More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0398 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.97 
 
 		 537 aa  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0398  GMC family oxidoreductase  100 
 
 		 544 aa  1115    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0332  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.5 
 
 		 544 aa  634  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.79 
 
 		 533 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6126  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.09 
 
 		 569 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939433 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6414  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.09 
 
 		 569 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.23 
 
 		 540 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.08 
 
 		 536 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  44.07 
 
 		 541 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.32 
 
 		 542 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.23 
 
 		 534 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.32 
 
 		 561 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.8 
 
 		 541 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.19 
 
 		 550 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3611  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.36 
 
 		 534 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.28 
 
 		 551 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  43.41 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.6 
 
 		 555 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.47 
 
 		 537 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.96 
 
 		 550 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5162  Choline dehydrogenase  43.29 
 
 		 541 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0769143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.38 
 
 		 546 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381853  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.67 
 
 		 563 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.08 
 
 		 534 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.53 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4211  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.86 
 
 		 559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.78 
 
 		 551 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.75 
 
 		 542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.48 
 
 		 532 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5265  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.59 
 
 		 546 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371791  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.24 
 
 		 531 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673966  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.65 
 
 		 552 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0958  GMC family oxidoreductase  43.88 
 
 		 532 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2869  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.86 
 
 		 531 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  42.91 
 
 		 554 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1712  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.21 
 
 		 536 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1397  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.26 
 
 		 532 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3292  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.29 
 
 		 533 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6221  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.84 
 
 		 551 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4024  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.29 
 
 		 533 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.87 
 
 		 531 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0899  GMC family oxidoreductase  43.69 
 
 		 532 aa  398  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.886406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.25 
 
 		 543 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  41.95 
 
 		 574 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0073  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.83 
 
 		 561 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0084  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.83 
 
 		 561 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6820  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.36 
 
 		 602 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1579  GMC family oxidoreductase  40.83 
 
 		 538 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3734  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.37 
 
 		 539 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569573  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0287  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.05 
 
 		 547 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.839819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  40.95 
 
 		 561 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6272  putative choline (or alcohol) dehydrogenase  42.41 
 
 		 544 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.56 
 
 		 534 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.96 
 
 		 577 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  39.85 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6015  choline dehydrogenase  41.99 
 
 		 570 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.639563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4278  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.94 
 
 		 546 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.93 
 
 		 539 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1169  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40 
 
 		 544 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.15 
 
 		 578 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.78 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.06 
 
 		 554 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3378  oxidoreductase, GMC family protein  43.02 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3995  GMC family oxidoreductase  43.02 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2933  oxidoreductase, GMC family protein  43.02 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  38.83 
 
 		 561 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3287  hypothetical protein  42.34 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4069  GMC family oxidoreductase  43.2 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2991  oxidoreductase, GMC family protein  43.02 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3358  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.44 
 
 		 550 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.41 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3916  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.83 
 
 		 570 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  39.01 
 
 		 561 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  38.83 
 
 		 561 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.2 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1610  oxidoreductase, GMC family protein  43.02 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0016  GMC family oxidoreductase  42.64 
 
 		 571 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  38.59 
 
 		 564 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  39.01 
 
 		 561 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2973  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.59 
 
 		 578 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.23 
 
 		 538 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.59 
 
 		 578 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  40.42 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5514  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.98 
 
 		 537 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6373  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  40.71 
 
 		 540 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3372  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  43.39 
 
 		 539 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0201  oxidoreductase, GMC family protein  42.64 
 
 		 561 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.260049  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3540  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.18 
 
 		 544 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3332  oxidoreductase, GMC family protein  42.47 
 
 		 561 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.04 
 
 		 546 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4518  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.94 
 
 		 550 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.173052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.48 
 
 		 529 aa  378  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3214  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42 
 
 		 544 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0159  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.44 
 
 		 560 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  38.96 
 
 		 565 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.09 
 
 		 547 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  38.46 
 
 		 556 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  38.01 
 
 		 560 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  38.87 
 
 		 552 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.12 
 
 		 567 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>