More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1300 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1300  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 478 aa  945    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1022  glucose-methanol-choline oxidoreductase  69.12 
 
 		 476 aa  641    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.980314  normal  0.873475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5056  glucose-methanol-choline oxidoreductase  82.26 
 
 		 472 aa  739    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1032  glucose-methanol-choline oxidoreductase  69.12 
 
 		 476 aa  641    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0392411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  68.91 
 
 		 503 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10711  dehydrogenase  61.47 
 
 		 479 aa  551  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.439336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.07 
 
 		 546 aa  243  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0317  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.91 
 
 		 511 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.16 
 
 		 543 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4747  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.3 
 
 		 527 aa  221  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.47 
 
 		 534 aa  213  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.91 
 
 		 549 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.96 
 
 		 529 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4076  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.49 
 
 		 516 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00359507  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  31.3 
 
 		 531 aa  209  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0889  choline dehydrogenase  32.04 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4709  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.59 
 
 		 527 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  31.54 
 
 		 562 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.76 
 
 		 541 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5514  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.14 
 
 		 537 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  31.3 
 
 		 549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.53 
 
 		 509 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.78 
 
 		 530 aa  196  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4278  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.03 
 
 		 546 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  30.94 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  31.71 
 
 		 562 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.03 
 
 		 541 aa  194  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.82 
 
 		 539 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  32.66 
 
 		 553 aa  193  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2709  choline dehydrogenase  30.8 
 
 		 549 aa  192  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7484  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.88 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  32.46 
 
 		 531 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  31.68 
 
 		 559 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3762  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.8 
 
 		 552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  29.72 
 
 		 560 aa  191  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7146  Choline dehydrogenase  33.27 
 
 		 514 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0527106 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  29.76 
 
 		 556 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  29.46 
 
 		 574 aa  190  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  32.23 
 
 		 559 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.78 
 
 		 542 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.42 
 
 		 556 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4867  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.73 
 
 		 560 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.42 
 
 		 548 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.42 
 
 		 556 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0845  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.52 
 
 		 536 aa  189  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2365  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.35 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000394511  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.28 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  30.3 
 
 		 561 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  30.3 
 
 		 561 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  30.3 
 
 		 561 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  30.3 
 
 		 561 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.1 
 
 		 529 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.8 
 
 		 518 aa  187  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  29.35 
 
 		 564 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  30.22 
 
 		 561 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.12 
 
 		 542 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6126  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.49 
 
 		 569 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.97 
 
 		 560 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.75 
 
 		 535 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.45 
 
 		 538 aa  186  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0554  choline dehydrogenase  30.43 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.2 
 
 		 540 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.86 
 
 		 536 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0174  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.05 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5414  choline dehydrogenase, a flavoprotein  32.25 
 
 		 534 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269281 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1896  choline dehydrogenase  31.41 
 
 		 550 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 		 550 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.57 
 
 		 536 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.87 
 
 		 535 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  29.65 
 
 		 560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0553  choline dehydrogenase  30.87 
 
 		 549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93918  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4942  choline dehydrogenase  30.71 
 
 		 520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.953244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6414  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.12 
 
 		 569 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31 
 
 		 555 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  30.74 
 
 		 551 aa  183  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.3 
 
 		 531 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1492  choline dehydrogenase  30.87 
 
 		 556 aa  183  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.97 
 
 		 542 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3345  putative choline dehydrogenase lipoprotein oxidoreductase  32.53 
 
 		 544 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.68 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0054  GMC oxidoreductase  31.82 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810146  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.74 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.37 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  29.1 
 
 		 561 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3358  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.44 
 
 		 550 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.65 
 
 		 552 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2450  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.76 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.389651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1169  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.62 
 
 		 544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1949  GMC family oxidoreductase  31.68 
 
 		 550 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0586145  unclonable  0.000000512241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2310  choline dehydrogenase  33.58 
 
 		 548 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.568209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  30.07 
 
 		 556 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.61 
 
 		 555 aa  180  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  30.02 
 
 		 551 aa  180  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6157  choline dehydrogenase  33.58 
 
 		 561 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3808  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.43 
 
 		 547 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.605068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3910  Choline dehydrogenase  31.73 
 
 		 531 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1514  choline dehydrogenase  31.11 
 
 		 560 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0264792  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5058  choline dehydrogenase  32.65 
 
 		 561 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0575159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  30.02 
 
 		 534 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3373  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.63 
 
 		 553 aa  179  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>