More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5056 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5056  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 472 aa  927    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1300  glucose-methanol-choline oxidoreductase  82.26 
 
 		 478 aa  765    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1022  glucose-methanol-choline oxidoreductase  69.7 
 
 		 476 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.980314  normal  0.873475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1032  glucose-methanol-choline oxidoreductase  69.7 
 
 		 476 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0392411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  69.7 
 
 		 503 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10711  dehydrogenase  60.38 
 
 		 479 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.439336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.51 
 
 		 546 aa  240  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.76 
 
 		 534 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.89 
 
 		 543 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4747  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.65 
 
 		 527 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0317  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.69 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.64 
 
 		 529 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.77 
 
 		 549 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4709  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30 
 
 		 527 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6414  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.73 
 
 		 569 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6126  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.92 
 
 		 569 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4942  choline dehydrogenase  32.88 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.953244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.3 
 
 		 518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.1 
 
 		 509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1169  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.63 
 
 		 544 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.54 
 
 		 541 aa  196  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  30.89 
 
 		 574 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  34.2 
 
 		 531 aa  192  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.14 
 
 		 542 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0174  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.22 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  30.54 
 
 		 562 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  30.91 
 
 		 561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  30.91 
 
 		 561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  30.91 
 
 		 561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2365  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.87 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000394511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  30.91 
 
 		 561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  32.77 
 
 		 570 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  30.65 
 
 		 531 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4076  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.52 
 
 		 516 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00359507  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7484  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.12 
 
 		 540 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.42 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  32.46 
 
 		 559 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.83 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  31.41 
 
 		 553 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  30.86 
 
 		 549 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3358  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.37 
 
 		 550 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4278  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.21 
 
 		 546 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.74 
 
 		 548 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010293  normal  0.0125106 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.94 
 
 		 540 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6157  choline dehydrogenase  32.78 
 
 		 561 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0056  GMC family oxidoreductase  30.56 
 
 		 550 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000620913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3762  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.22 
 
 		 552 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  30 
 
 		 560 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3214  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.54 
 
 		 544 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.41 
 
 		 541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3063  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.87 
 
 		 559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.924929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2554  choline dehydrogenase  31.65 
 
 		 559 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102453  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.01 
 
 		 539 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  30.96 
 
 		 561 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3373  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.04 
 
 		 553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1492  choline dehydrogenase  31.78 
 
 		 556 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.78 
 
 		 537 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  32.66 
 
 		 556 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  32.66 
 
 		 556 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  32.66 
 
 		 556 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0889  choline dehydrogenase  30.61 
 
 		 549 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  32.82 
 
 		 545 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3292  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.74 
 
 		 533 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4024  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.74 
 
 		 533 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5514  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.97 
 
 		 537 aa  183  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  30.86 
 
 		 549 aa  183  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.06 
 
 		 555 aa  183  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3540  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.34 
 
 		 544 aa  183  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  31.77 
 
 		 559 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7146  Choline dehydrogenase  32.83 
 
 		 514 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0527106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.74 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000289824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  31.95 
 
 		 559 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.59 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2838  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.41 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.97 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.36 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  31.96 
 
 		 551 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.47 
 
 		 531 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.46 
 
 		 556 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70940  choline dehydrogenase  32.22 
 
 		 561 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1710  choline dehydrogenase  33.09 
 
 		 561 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  31.84 
 
 		 553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2709  choline dehydrogenase  29.96 
 
 		 549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1925  choline dehydrogenase  32.41 
 
 		 565 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0217321  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.35 
 
 		 556 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0377  choline dehydrogenase  32.41 
 
 		 565 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1837  choline dehydrogenase  32.41 
 
 		 565 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.25 
 
 		 515 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.49 
 
 		 600 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.231686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  30.6 
 
 		 550 aa  179  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.3 
 
 		 530 aa  179  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  29.81 
 
 		 556 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.73 
 
 		 530 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31690  choline dehydrogenase  31.16 
 
 		 554 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5414  choline dehydrogenase, a flavoprotein  32.9 
 
 		 534 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3115  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.46 
 
 		 546 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2688  choline dehydrogenase  30.19 
 
 		 569 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.46 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2634  choline dehydrogenase  30.19 
 
 		 569 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1072  choline dehydrogenase  32.04 
 
 		 565 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00240234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>