More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1005 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1022  glucose-methanol-choline oxidoreductase  99.79 
 
 		 476 aa  931    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.980314  normal  0.873475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1300  glucose-methanol-choline oxidoreductase  68.91 
 
 		 478 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 503 aa  982    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1032  glucose-methanol-choline oxidoreductase  99.79 
 
 		 476 aa  931    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0392411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5056  glucose-methanol-choline oxidoreductase  69.7 
 
 		 472 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10711  dehydrogenase  59.54 
 
 		 479 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.439336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.4 
 
 		 546 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.32 
 
 		 534 aa  226  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4747  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.22 
 
 		 527 aa  226  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  32.52 
 
 		 570 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  32 
 
 		 549 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0317  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.21 
 
 		 511 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.88 
 
 		 576 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.58 
 
 		 576 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5514  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.2 
 
 		 537 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4278  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.93 
 
 		 546 aa  214  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.6 
 
 		 518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.52 
 
 		 509 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.62 
 
 		 542 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.03 
 
 		 538 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.78 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.62 
 
 		 542 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.3 
 
 		 536 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0174  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.13 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  31.53 
 
 		 574 aa  211  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3762  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.95 
 
 		 552 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0054  GMC oxidoreductase  33.33 
 
 		 556 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.52 
 
 		 531 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7484  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.48 
 
 		 540 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.77 
 
 		 541 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.1 
 
 		 539 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4076  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.49 
 
 		 516 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00359507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0194  GMC family oxidoreductase  33.15 
 
 		 548 aa  207  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  30.74 
 
 		 549 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.68 
 
 		 535 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.65 
 
 		 529 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  31.78 
 
 		 562 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  31.58 
 
 		 552 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  31.03 
 
 		 553 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.02 
 
 		 530 aa  204  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.01 
 
 		 556 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4709  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.84 
 
 		 527 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0554  choline dehydrogenase  29.91 
 
 		 549 aa  203  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  33.52 
 
 		 556 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  33.52 
 
 		 556 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  33.52 
 
 		 556 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  31.83 
 
 		 534 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.28 
 
 		 539 aa  202  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.28 
 
 		 530 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1896  choline dehydrogenase  32.16 
 
 		 550 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3929  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.71 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0553  choline dehydrogenase  29.72 
 
 		 549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93918  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.87 
 
 		 529 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0889  choline dehydrogenase  30.56 
 
 		 549 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2709  choline dehydrogenase  29.78 
 
 		 549 aa  201  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.83 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.83 
 
 		 556 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  32.44 
 
 		 531 aa  201  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3808  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.54 
 
 		 547 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.605068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3358  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.27 
 
 		 550 aa  199  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0123  putative alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  33.09 
 
 		 574 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 		 550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.8 
 
 		 535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  34.58 
 
 		 545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  31.8 
 
 		 553 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.78 
 
 		 560 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  32.77 
 
 		 531 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.65 
 
 		 555 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.58 
 
 		 531 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4183  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.16 
 
 		 557 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1882  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.09 
 
 		 534 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0203  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  33.15 
 
 		 559 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.58 
 
 		 571 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  30.74 
 
 		 549 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6820  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.85 
 
 		 602 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.32 
 
 		 600 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.231686 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.6 
 
 		 546 aa  196  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1635  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.8 
 
 		 534 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643208  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  31.55 
 
 		 556 aa  196  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06179  choline dehydrogenase  28.49 
 
 		 569 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.09 
 
 		 541 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7146  Choline dehydrogenase  31.73 
 
 		 514 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0527106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.71 
 
 		 534 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.917916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.31 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5414  choline dehydrogenase, a flavoprotein  33.02 
 
 		 534 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269281 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2659  GMC oxidoreductase  33.46 
 
 		 549 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1833  GMC oxidoreductase  33.46 
 
 		 549 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.02 
 
 		 554 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2719  GMC oxidoreductase  33.46 
 
 		 549 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972032  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3115  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.15 
 
 		 546 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3294  GMC oxidoreductase  33.46 
 
 		 549 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38455  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2365  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.28 
 
 		 517 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000394511  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.81 
 
 		 532 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1035  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.87 
 
 		 609 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3067  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.52 
 
 		 546 aa  193  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.35 
 
 		 534 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.2 
 
 		 562 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.96 
 
 		 546 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.8 
 
 		 561 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  28.97 
 
 		 561 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>