More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0646 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 546 aa  1097    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4747  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.48 
 
 		 527 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2365  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.97 
 
 		 517 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000394511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3899  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.52 
 
 		 512 aa  365  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306952  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6326  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38 
 
 		 554 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  37.73 
 
 		 570 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  36.61 
 
 		 559 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  33.51 
 
 		 560 aa  290  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  36.96 
 
 		 553 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  37.68 
 
 		 559 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.52 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.47 
 
 		 515 aa  283  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.08 
 
 		 518 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.72 
 
 		 541 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.26 
 
 		 550 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  33.27 
 
 		 556 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  34.89 
 
 		 534 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1582  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.35 
 
 		 533 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  32.49 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  32.85 
 
 		 561 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  32.85 
 
 		 561 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  32.85 
 
 		 561 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  32.85 
 
 		 561 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  32.49 
 
 		 562 aa  267  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  32.37 
 
 		 560 aa  267  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.09 
 
 		 529 aa  267  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.58 
 
 		 543 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00267  choline dehydrogenase  34.28 
 
 		 556 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0326  choline dehydrogenase  34.28 
 
 		 556 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0370  choline dehydrogenase  34.28 
 
 		 556 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00270  hypothetical protein  34.28 
 
 		 556 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  34.33 
 
 		 562 aa  266  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4076  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.76 
 
 		 516 aa  266  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00359507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  33.51 
 
 		 561 aa  266  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3295  choline dehydrogenase  34.1 
 
 		 556 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  34.81 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3312  choline dehydrogenase  34.1 
 
 		 556 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  33.76 
 
 		 562 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  34.06 
 
 		 549 aa  263  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  32.19 
 
 		 564 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  32.37 
 
 		 565 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  32.97 
 
 		 549 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.77 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.83 
 
 		 534 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  36.46 
 
 		 545 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.94 
 
 		 509 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8399  choline dehydrogenase  35.48 
 
 		 574 aa  259  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.7 
 
 		 554 aa  259  9e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.24 
 
 		 539 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.7 
 
 		 535 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0481  choline dehydrogenase  34.35 
 
 		 565 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.1 
 
 		 540 aa  258  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  30.23 
 
 		 560 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0342  choline dehydrogenase  33.87 
 
 		 562 aa  257  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2709  choline dehydrogenase  31.66 
 
 		 549 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  34.39 
 
 		 541 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06179  choline dehydrogenase  31.46 
 
 		 569 aa  257  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  33.04 
 
 		 559 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  32.26 
 
 		 572 aa  256  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5834  choline dehydrogenase  34.17 
 
 		 577 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4867  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 		 560 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.81 
 
 		 536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.48 
 
 		 552 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  32.5 
 
 		 565 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  33.51 
 
 		 562 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1624  choline dehydrogenase  35.45 
 
 		 558 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1515  choline dehydrogenase  33.45 
 
 		 555 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.307618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0554  choline dehydrogenase  32.02 
 
 		 549 aa  253  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000364  choline dehydrogenase  30.6 
 
 		 571 aa  253  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1144  choline dehydrogenase  33.87 
 
 		 551 aa  253  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6272  putative choline (or alcohol) dehydrogenase  34.94 
 
 		 544 aa  253  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1639  choline dehydrogenase  35.68 
 
 		 558 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.58518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.04 
 
 		 530 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  34.52 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5414  choline dehydrogenase, a flavoprotein  34 
 
 		 534 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269281 
 
 
-
 
NC_004310  BR0553  choline dehydrogenase  31.84 
 
 		 549 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2727  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.57 
 
 		 525 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2310  choline dehydrogenase  33.09 
 
 		 548 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.568209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  32.74 
 
 		 574 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1514  choline dehydrogenase  33.03 
 
 		 560 aa  252  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0264792  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1882  choline dehydrogenase  32.07 
 
 		 551 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1710  choline dehydrogenase  35.03 
 
 		 561 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0889  choline dehydrogenase  32.43 
 
 		 549 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2688  choline dehydrogenase  33.51 
 
 		 569 aa  251  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2634  choline dehydrogenase  33.51 
 
 		 569 aa  251  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  34.97 
 
 		 557 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  31.41 
 
 		 561 aa  249  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.71 
 
 		 534 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1925  choline dehydrogenase  33.51 
 
 		 565 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0217321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1837  choline dehydrogenase  33.51 
 
 		 565 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  34.47 
 
 		 556 aa  249  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  34.61 
 
 		 544 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0377  choline dehydrogenase  33.51 
 
 		 565 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119078  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6848  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.77 
 
 		 556 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.8 
 
 		 537 aa  249  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3358  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.14 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.83 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4732  choline dehydrogenase  32.01 
 
 		 568 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.98 
 
 		 533 aa  247  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1832  choline dehydrogenase  33.39 
 
 		 560 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.287087  normal  0.448798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>