More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0758 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 523 aa  1060    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.245711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.72 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.263067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2501  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.72 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2464  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.72 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.074328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.09 
 
 		 511 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.433045  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.65 
 
 		 527 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2794  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.83 
 
 		 525 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3687  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.87 
 
 		 546 aa  455  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3743  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.79 
 
 		 527 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22540  choline oxidase  48.36 
 
 		 535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155737  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5406  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.22 
 
 		 525 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.702828  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01429  choline oxidase (CodA), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04090)  45.57 
 
 		 542 aa  433  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262126 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.51 
 
 		 518 aa  324  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2727  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40 
 
 		 525 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  38 
 
 		 531 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.22 
 
 		 534 aa  292  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0554  choline dehydrogenase  35.33 
 
 		 549 aa  291  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.48 
 
 		 537 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.5 
 
 		 546 aa  290  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0553  choline dehydrogenase  35.63 
 
 		 549 aa  289  9e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  36.82 
 
 		 562 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2310  choline dehydrogenase  36.52 
 
 		 548 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.568209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.58 
 
 		 529 aa  288  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  35.07 
 
 		 549 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1882  choline dehydrogenase  35.86 
 
 		 551 aa  286  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.78 
 
 		 543 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.63 
 
 		 541 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2709  choline dehydrogenase  34.64 
 
 		 549 aa  283  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  35.71 
 
 		 552 aa  282  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  36.21 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.38 
 
 		 534 aa  280  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  38.32 
 
 		 557 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.31 
 
 		 542 aa  279  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.84 
 
 		 541 aa  279  9e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.06 
 
 		 539 aa  279  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  34.82 
 
 		 541 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31690  choline dehydrogenase  35.05 
 
 		 554 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.41 
 
 		 533 aa  279  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2184  choline dehydrogenase  35.39 
 
 		 548 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  34.33 
 
 		 549 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.14 
 
 		 541 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  37.5 
 
 		 551 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0889  choline dehydrogenase  33.96 
 
 		 549 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.45 
 
 		 529 aa  277  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0856  choline dehydrogenase  35.39 
 
 		 548 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.69 
 
 		 534 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.09 
 
 		 555 aa  276  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  35.19 
 
 		 534 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0317  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.48 
 
 		 511 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  34.9 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.2 
 
 		 535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.51 
 
 		 563 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.51 
 
 		 532 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2822  choline dehydrogenase  35.39 
 
 		 551 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2716  putative GMC oxidoreductase  36.87 
 
 		 562 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.09 
 
 		 571 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  35.87 
 
 		 551 aa  272  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.53 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1896  choline dehydrogenase  35.36 
 
 		 550 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 		 550 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.41 
 
 		 551 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.77 
 
 		 555 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  35.3 
 
 		 544 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.58 
 
 		 560 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0174  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.41 
 
 		 552 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0572  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.07 
 
 		 531 aa  270  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0931268  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3067  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.89 
 
 		 546 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1144  choline dehydrogenase  34.26 
 
 		 551 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1882  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.59 
 
 		 534 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.78 
 
 		 534 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.917916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  34.18 
 
 		 559 aa  269  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  37.73 
 
 		 570 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.89 
 
 		 556 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.65 
 
 		 530 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4708  Choline dehydrogenase  35.88 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.45 
 
 		 576 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  35.13 
 
 		 559 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4211  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.34 
 
 		 559 aa  267  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  36.41 
 
 		 545 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3762  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.67 
 
 		 552 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.93 
 
 		 539 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0194  GMC family oxidoreductase  35.65 
 
 		 548 aa  266  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6272  putative choline (or alcohol) dehydrogenase  35.19 
 
 		 544 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0130  choline dehydrogenase  33.52 
 
 		 547 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105235  normal  0.777409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1383  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.37 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00471975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.69 
 
 		 542 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.82 
 
 		 535 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6221  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.4 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.51 
 
 		 556 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.46 
 
 		 548 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.39 
 
 		 600 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.231686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0203  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  36.68 
 
 		 559 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3929  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.47 
 
 		 528 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4867  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.95 
 
 		 560 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  35.48 
 
 		 546 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  37.33 
 
 		 1290 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.73 
 
 		 576 aa  263  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.45 
 
 		 544 aa  262  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2719  GMC oxidoreductase  35.03 
 
 		 549 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  34.96 
 
 		 559 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>