More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2794 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_22540  choline oxidase  70.23 
 
 		 535 aa  723    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155737  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  71.67 
 
 		 527 aa  764    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2794  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 525 aa  1078    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3687  glucose-methanol-choline oxidoreductase  73.85 
 
 		 546 aa  776    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3743  glucose-methanol-choline oxidoreductase  72.83 
 
 		 527 aa  771    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.49 
 
 		 511 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.433045  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.39 
 
 		 507 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.263067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2464  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.39 
 
 		 507 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.074328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2501  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.39 
 
 		 507 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.83 
 
 		 523 aa  475  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.245711  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5406  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.55 
 
 		 525 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.702828  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01429  choline oxidase (CodA), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04090)  42.32 
 
 		 542 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262126 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.91 
 
 		 518 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  37.05 
 
 		 531 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.35 
 
 		 529 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6221  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.58 
 
 		 551 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  34.07 
 
 		 550 aa  293  8e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.33 
 
 		 546 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  36.81 
 
 		 541 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2727  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.57 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.26 
 
 		 551 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.22 
 
 		 539 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.86 
 
 		 542 aa  289  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.73 
 
 		 550 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.29 
 
 		 551 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3910  Choline dehydrogenase  36.62 
 
 		 531 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4708  Choline dehydrogenase  36.45 
 
 		 513 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0123  putative alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  37.74 
 
 		 574 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.31 
 
 		 549 aa  286  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.41 
 
 		 537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.35 
 
 		 551 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.08 
 
 		 551 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.15 
 
 		 541 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.22 
 
 		 544 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  36.55 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.14 
 
 		 547 aa  281  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.24 
 
 		 539 aa  280  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  34.77 
 
 		 559 aa  279  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.61 
 
 		 541 aa  279  9e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.29 
 
 		 555 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1614  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  34.53 
 
 		 547 aa  278  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2557  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.59 
 
 		 526 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  37.36 
 
 		 551 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.57 
 
 		 556 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.58 
 
 		 538 aa  277  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1035  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.96 
 
 		 609 aa  277  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3929  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.47 
 
 		 528 aa  276  6e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.57 
 
 		 556 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0073  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.64 
 
 		 561 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  35.98 
 
 		 551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0554  choline dehydrogenase  35.06 
 
 		 549 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.77 
 
 		 548 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2310  choline dehydrogenase  35.42 
 
 		 548 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.568209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.56 
 
 		 576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  35.77 
 
 		 557 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.1 
 
 		 561 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0553  choline dehydrogenase  34.87 
 
 		 549 aa  274  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.55 
 
 		 571 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1383  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.04 
 
 		 551 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00471975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1144  choline dehydrogenase  34.26 
 
 		 551 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.1 
 
 		 578 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2973  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.1 
 
 		 578 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  34.64 
 
 		 546 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.41 
 
 		 600 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.231686 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6848  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.58 
 
 		 556 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0084  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.27 
 
 		 561 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.23 
 
 		 534 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  34.38 
 
 		 534 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3506  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.59 
 
 		 575 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145411  normal  0.0815254 
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  35.42 
 
 		 544 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.75 
 
 		 536 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.08 
 
 		 571 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3214  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.66 
 
 		 544 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.92 
 
 		 577 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.36 
 
 		 541 aa  271  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.8 
 
 		 542 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.98 
 
 		 529 aa  269  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  34.58 
 
 		 559 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3372  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  35.48 
 
 		 539 aa  269  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  35.12 
 
 		 545 aa  269  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.4 
 
 		 560 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0889  choline dehydrogenase  35.06 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.21 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2450  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.43 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.389651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.8 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3540  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.48 
 
 		 544 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 		 559 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5834  choline dehydrogenase  34.4 
 
 		 577 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.85 
 
 		 537 aa  267  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1258  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.61 
 
 		 571 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564674  decreased coverage  0.00861873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3579  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.58 
 
 		 539 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000745521  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.97 
 
 		 552 aa  266  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  34.75 
 
 		 549 aa  266  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0317  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.01 
 
 		 511 aa  266  8.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2869  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.77 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4369  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.88 
 
 		 556 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  34.25 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  37 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37 
 
 		 531 aa  264  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.48 
 
 		 563 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>