More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22540 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  67.75 
 
 		 527 aa  726    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2794  glucose-methanol-choline oxidoreductase  70.23 
 
 		 525 aa  723    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3687  glucose-methanol-choline oxidoreductase  70.91 
 
 		 546 aa  735    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22540  choline oxidase  100 
 
 		 535 aa  1102    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155737  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3743  glucose-methanol-choline oxidoreductase  69.23 
 
 		 527 aa  722    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.88 
 
 		 511 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.433045  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2501  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.4 
 
 		 507 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2464  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.4 
 
 		 507 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.074328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.4 
 
 		 507 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.263067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.91 
 
 		 523 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.245711  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5406  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.12 
 
 		 525 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.702828  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01429  choline oxidase (CodA), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04090)  41.24 
 
 		 542 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262126 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.45 
 
 		 518 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  38.78 
 
 		 546 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.7 
 
 		 529 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  38.12 
 
 		 550 aa  327  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.45 
 
 		 535 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  38.15 
 
 		 541 aa  323  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  39.71 
 
 		 557 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.86 
 
 		 549 aa  319  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0084  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.09 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0073  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.09 
 
 		 561 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.19 
 
 		 530 aa  317  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0203  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  39 
 
 		 559 aa  316  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0123  putative alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  39.03 
 
 		 574 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2869  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.03 
 
 		 531 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.77 
 
 		 544 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6015  choline dehydrogenase  37.82 
 
 		 570 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.639563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  37.12 
 
 		 531 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2716  putative GMC oxidoreductase  37.41 
 
 		 562 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.43 
 
 		 546 aa  313  5.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.47 
 
 		 538 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.91 
 
 		 576 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  37.32 
 
 		 534 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.14 
 
 		 539 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.95 
 
 		 561 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3929  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.75 
 
 		 528 aa  310  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.25 
 
 		 577 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.66 
 
 		 529 aa  309  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.78 
 
 		 537 aa  309  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6848  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.9 
 
 		 556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2973  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.58 
 
 		 578 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.58 
 
 		 578 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.7 
 
 		 536 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  35.68 
 
 		 574 aa  306  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0889  choline dehydrogenase  37.77 
 
 		 549 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.56 
 
 		 541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.07 
 
 		 576 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.76 
 
 		 578 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  37.39 
 
 		 549 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  36.4 
 
 		 559 aa  303  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  37.5 
 
 		 549 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4708  Choline dehydrogenase  37.14 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.53 
 
 		 534 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.45 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3762  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.77 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.19 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  37.45 
 
 		 553 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  39.01 
 
 		 531 aa  301  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0174  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.42 
 
 		 552 aa  301  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  36.97 
 
 		 551 aa  301  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.46 
 
 		 555 aa  300  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2727  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.39 
 
 		 525 aa  300  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3214  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.04 
 
 		 544 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.43 
 
 		 571 aa  299  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.62 
 
 		 560 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0554  choline dehydrogenase  35.57 
 
 		 549 aa  299  9e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0194  GMC family oxidoreductase  37.77 
 
 		 548 aa  299  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0553  choline dehydrogenase  35.39 
 
 		 549 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5834  choline dehydrogenase  37.66 
 
 		 577 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0016  GMC family oxidoreductase  36.43 
 
 		 571 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3540  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.04 
 
 		 544 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3521  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.29 
 
 		 555 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  38.72 
 
 		 562 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.27 
 
 		 548 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.48 
 
 		 567 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.05 
 
 		 542 aa  297  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.95 
 
 		 534 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.917916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.34 
 
 		 556 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  35.98 
 
 		 553 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0572  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.33 
 
 		 531 aa  296  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0931268  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.87 
 
 		 571 aa  296  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.41 
 
 		 551 aa  296  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.15 
 
 		 556 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1383  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.08 
 
 		 551 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00471975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.13 
 
 		 550 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0159  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.88 
 
 		 560 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.77 
 
 		 542 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.31 
 
 		 600 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.231686 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  36.65 
 
 		 545 aa  294  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.56 
 
 		 539 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3067  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.46 
 
 		 546 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.29 
 
 		 541 aa  294  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3345  putative choline dehydrogenase lipoprotein oxidoreductase  37.04 
 
 		 544 aa  292  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3434  GMC family oxidoreductase  34.5 
 
 		 539 aa  293  8e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2709  choline dehydrogenase  35.21 
 
 		 549 aa  292  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6221  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35 
 
 		 551 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3916  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.7 
 
 		 570 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  36.28 
 
 		 544 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3372  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  36.58 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>