More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3494 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 527 aa  1095    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3687  glucose-methanol-choline oxidoreductase  81.36 
 
 		 546 aa  869    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22540  choline oxidase  67.75 
 
 		 535 aa  726    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155737  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2794  glucose-methanol-choline oxidoreductase  71.81 
 
 		 525 aa  763    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3743  glucose-methanol-choline oxidoreductase  86.29 
 
 		 527 aa  938    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.28 
 
 		 507 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.263067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2501  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.28 
 
 		 507 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2464  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.28 
 
 		 507 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.074328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.23 
 
 		 511 aa  600  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.433045  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.75 
 
 		 523 aa  477  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.245711  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5406  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.88 
 
 		 525 aa  425  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.702828  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01429  choline oxidase (CodA), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04090)  41.3 
 
 		 542 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.98 
 
 		 549 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  36.86 
 
 		 531 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.39 
 
 		 518 aa  326  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 		 550 aa  310  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0123  putative alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  37.37 
 
 		 574 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  35.78 
 
 		 546 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.92 
 
 		 537 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.9 
 
 		 542 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.83 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.9 
 
 		 556 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4708  Choline dehydrogenase  35.63 
 
 		 513 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34 
 
 		 538 aa  297  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.63 
 
 		 529 aa  296  5e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.72 
 
 		 556 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35 
 
 		 534 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2716  putative GMC oxidoreductase  36.14 
 
 		 562 aa  293  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.06 
 
 		 576 aa  293  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.48 
 
 		 536 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  35.54 
 
 		 541 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.37 
 
 		 555 aa  289  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3540  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.12 
 
 		 544 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3762  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.16 
 
 		 552 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.52 
 
 		 576 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3214  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.67 
 
 		 544 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  36.56 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.81 
 
 		 529 aa  287  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6015  choline dehydrogenase  34.67 
 
 		 570 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.639563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.62 
 
 		 542 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  35.49 
 
 		 551 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6221  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.64 
 
 		 551 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.25 
 
 		 541 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.68 
 
 		 539 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.47 
 
 		 546 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  35.06 
 
 		 545 aa  282  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.39 
 
 		 550 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0084  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.63 
 
 		 561 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0073  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34 
 
 		 561 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  34.75 
 
 		 544 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.36 
 
 		 541 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.15 
 
 		 551 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.15 
 
 		 551 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.65 
 
 		 571 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  36.18 
 
 		 552 aa  279  7e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  33.57 
 
 		 559 aa  279  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1614  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  34.05 
 
 		 547 aa  278  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3372  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  34.68 
 
 		 539 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.82 
 
 		 577 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3521  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.06 
 
 		 555 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.57 
 
 		 543 aa  279  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.31 
 
 		 567 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485972  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3345  putative choline dehydrogenase lipoprotein oxidoreductase  34.94 
 
 		 544 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.03 
 
 		 532 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  35.1 
 
 		 562 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  36.12 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.06 
 
 		 547 aa  278  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.11 
 
 		 575 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.214688 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  37.18 
 
 		 531 aa  278  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.48 
 
 		 600 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.231686 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3295  choline dehydrogenase  35.1 
 
 		 556 aa  278  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3434  GMC family oxidoreductase  31.69 
 
 		 539 aa  277  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0326  choline dehydrogenase  35.1 
 
 		 556 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3312  choline dehydrogenase  35.1 
 
 		 556 aa  278  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0174  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.86 
 
 		 552 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0370  choline dehydrogenase  35.1 
 
 		 556 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.51 
 
 		 544 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00267  choline dehydrogenase  34.93 
 
 		 556 aa  277  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3803  putative choline dehydrogenase lipoprotein oxidoreductase  35.04 
 
 		 548 aa  277  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.3 
 
 		 551 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00270  hypothetical protein  34.93 
 
 		 556 aa  277  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37 
 
 		 531 aa  276  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.78 
 
 		 563 aa  276  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0056  GMC family oxidoreductase  35.28 
 
 		 550 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000620913 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  34.38 
 
 		 551 aa  276  9e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2176  choline dehydrogenase  33.63 
 
 		 572 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0203  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  35.29 
 
 		 559 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  34.12 
 
 		 534 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0075  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.82 
 
 		 548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0217236  hitchhiker  0.000000000166725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2727  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.38 
 
 		 525 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1624  choline dehydrogenase  34.8 
 
 		 558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3067  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.77 
 
 		 546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0317  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.57 
 
 		 511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.41 
 
 		 551 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.09 
 
 		 561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2869  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.4 
 
 		 531 aa  274  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2634  choline dehydrogenase  33.87 
 
 		 569 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.55 
 
 		 548 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000289824 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2688  choline dehydrogenase  33.87 
 
 		 569 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2973  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.09 
 
 		 578 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>