More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08910 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08910  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
305 aa  612  9.999999999999999e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000637944  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  58 
 
 
324 aa  339  4e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  49.66 
 
 
304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  48.46 
 
 
308 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  44.93 
 
 
318 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  45.27 
 
 
318 aa  265  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  45.27 
 
 
321 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  45.27 
 
 
321 aa  265  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  45.27 
 
 
321 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  45.27 
 
 
318 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  45.27 
 
 
318 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  45.27 
 
 
318 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  44.59 
 
 
318 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  45.08 
 
 
318 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  44.19 
 
 
310 aa  261  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  44.26 
 
 
318 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  44.19 
 
 
309 aa  260  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  45.3 
 
 
318 aa  258  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  44.63 
 
 
311 aa  258  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  44.63 
 
 
311 aa  258  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  45.23 
 
 
308 aa  258  8e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  44.97 
 
 
315 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  45.61 
 
 
308 aa  255  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  43.71 
 
 
304 aa  252  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  44.59 
 
 
311 aa  252  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  45.67 
 
 
320 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  44.78 
 
 
334 aa  248  8e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  42.66 
 
 
334 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  42.86 
 
 
340 aa  248  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  44.44 
 
 
306 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  45.87 
 
 
306 aa  247  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  43.85 
 
 
317 aa  245  8e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  44.18 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  42.38 
 
 
309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  43.52 
 
 
317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  44.18 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  42.67 
 
 
310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  41.53 
 
 
409 aa  241  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  43.77 
 
 
320 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  44.11 
 
 
311 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  46.76 
 
 
336 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  43.05 
 
 
304 aa  239  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  45.64 
 
 
332 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  47.12 
 
 
318 aa  239  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  42 
 
 
326 aa  239  5.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  45.73 
 
 
331 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  44.75 
 
 
340 aa  238  8e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  41 
 
 
323 aa  238  8e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  42.81 
 
 
396 aa  238  9e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  41.81 
 
 
308 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  44.81 
 
 
320 aa  238  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.1 
 
 
306 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  42.33 
 
 
312 aa  236  4e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  43.65 
 
 
310 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  44.71 
 
 
315 aa  235  7e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  42.28 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  42.86 
 
 
316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  43.73 
 
 
310 aa  233  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  43.88 
 
 
313 aa  232  6e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  42.14 
 
 
307 aa  231  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  43.88 
 
 
311 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  40.52 
 
 
314 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  45.21 
 
 
314 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  43.77 
 
 
311 aa  230  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.74 
 
 
407 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  46 
 
 
320 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.53 
 
 
326 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  40.8 
 
 
302 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  43.88 
 
 
311 aa  229  4e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  42.95 
 
 
322 aa  229  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  42.86 
 
 
311 aa  229  6e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  44.76 
 
 
325 aa  229  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  42.19 
 
 
320 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  40.8 
 
 
547 aa  227  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  43 
 
 
310 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  44.37 
 
 
333 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  45.79 
 
 
325 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  45.21 
 
 
314 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  44.37 
 
 
333 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  44.37 
 
 
333 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  44.68 
 
 
327 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  43.34 
 
 
331 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  42.62 
 
 
319 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  41.5 
 
 
311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  42.51 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  44.9 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  42.71 
 
 
314 aa  225  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  40.21 
 
 
308 aa  225  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  43.06 
 
 
317 aa  225  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  43.73 
 
 
353 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  41.28 
 
 
359 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  43.4 
 
 
362 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  41.84 
 
 
310 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  43.34 
 
 
330 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  43.39 
 
 
348 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  41.22 
 
 
311 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0401  Thioredoxin-disulfide reductase  41.78 
 
 
307 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0543651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  42.14 
 
 
315 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  41.25 
 
 
310 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  42.03 
 
 
319 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>