46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3685 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3685  amine oxidase  100 
 
 		 687 aa  1427    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5079  hypothetical protein  79.91 
 
 		 687 aa  1172    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1533  amine oxidase  75.48 
 
 		 682 aa  1113    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3193  methyltransferase type 11  86.05 
 
 		 689 aa  1249    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.212638  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3456  methyltransferase type 11  81.58 
 
 		 698 aa  1199    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0101492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2287  methyltransferase type 11  86.47 
 
 		 688 aa  1246    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245071  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1545  amine oxidase  42.34 
 
 		 732 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 219 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  26.35 
 
 		 219 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5641  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.06 
 
 		 220 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  22.09 
 
 		 464 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  22.01 
 
 		 491 aa  50.8  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  21.43 
 
 		 490 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  38.46 
 
 		 349 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  35 
 
 		 496 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  21.35 
 
 		 487 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  21.11 
 
 		 482 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  21.11 
 
 		 482 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  21.11 
 
 		 487 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  21.11 
 
 		 482 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  21.11 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1411  thioredoxin reductase  35.87 
 
 		 313 aa  47  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  41.51 
 
 		 557 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  22.09 
 
 		 474 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  29.73 
 
 		 217 aa  46.6  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0801  putative methyltransferase  29.73 
 
 		 217 aa  46.2  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  40.45 
 
 		 516 aa  46.6  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 276 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  38.03 
 
 		 494 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  20.65 
 
 		 485 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  21.5 
 
 		 484 aa  45.8  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  32.14 
 
 		 330 aa  45.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  20.65 
 
 		 490 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  20.97 
 
 		 490 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 221 aa  45.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  52.38 
 
 		 482 aa  44.3  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 		 241 aa  44.3  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  19.16 
 
 		 454 aa  44.3  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0142  thioredoxin-disulfide reductase  34.78 
 
 		 312 aa  44.3  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0182  thioredoxin-disulfide reductase  34.78 
 
 		 312 aa  43.9  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.68776  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0161  thioredoxin-disulfide reductase  34.78 
 
 		 312 aa  43.9  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  44.26 
 
 		 653 aa  43.9  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  20.34 
 
 		 463 aa  43.9  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 235 aa  43.9  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  30.61 
 
 		 409 aa  43.9  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>