More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5641 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5641  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  100 
 
 
220 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  54.59 
 
 
223 aa  259  1e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  53.85 
 
 
221 aa  252  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1590  methyltransferase  47.42 
 
 
219 aa  202  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  43.56 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  43.07 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  42.44 
 
 
217 aa  141  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0801  putative methyltransferase  42.44 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2743  methyltransferase type 12  30.61 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.94 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.5 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2675  hypothetical protein  28.49 
 
 
289 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2185  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.29 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120523  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 
810 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.59 
 
 
251 aa  58.2  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2403  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
270 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2287  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
688 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245071  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
295 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.08 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1295  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.39 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3551  demethylmenaquinone methyltransferase  32.31 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0405  demethylmenaquinone methyltransferase  32.31 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.403287  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  32.31 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.19 
 
 
252 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 
240 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.71 
 
 
251 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.71 
 
 
251 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.75 
 
 
236 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.15 
 
 
251 aa  55.1  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
487 aa  55.1  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.97 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2759  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.13 
 
 
249 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2650  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.067766  normal  0.282604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  31.3 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184412  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2783  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3685  amine oxidase  31.06 
 
 
687 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336746  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.57 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.91 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1237  hypothetical protein  35.48 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
295 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  36.67 
 
 
261 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
272 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  23.72 
 
 
226 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  35.09 
 
 
268 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3193  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
689 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.212638  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.48 
 
 
243 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
259 aa  52  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
262 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
206 aa  52.4  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  25.31 
 
 
317 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 
265 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 
269 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0186  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0844  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  34.48 
 
 
246 aa  51.6  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  32.06 
 
 
269 aa  52  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2760  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793539  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0683  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0667  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.35 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  31.39 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.62 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  29.66 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4330  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.47 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0567  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.76 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.12 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  24.83 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0458  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.76 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.886741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  30.08 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.73 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
281 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.68 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0166  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>