30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2287 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2287  methyltransferase type 11  100 
 
 		 688 aa  1418    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245071  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3685  amine oxidase  86.28 
 
 		 687 aa  1252    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3456  methyltransferase type 11  82.23 
 
 		 698 aa  1194    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0101492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3193  methyltransferase type 11  90.71 
 
 		 689 aa  1300    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.212638  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1533  amine oxidase  76.65 
 
 		 682 aa  1112    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5079  hypothetical protein  79.33 
 
 		 687 aa  1152    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1545  amine oxidase  42.56 
 
 		 732 aa  568  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5641  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.12 
 
 		 220 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 276 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  25.34 
 
 		 473 aa  51.2  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  39.56 
 
 		 349 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 187 aa  48.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  47.73 
 
 		 557 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 252 aa  47.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  30 
 
 		 325 aa  47.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  57.5 
 
 		 482 aa  47.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 219 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  32.97 
 
 		 219 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  33.7 
 
 		 217 aa  46.2  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  33.88 
 
 		 233 aa  45.8  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  39.44 
 
 		 494 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  32.5 
 
 		 496 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0801  putative methyltransferase  33.7 
 
 		 217 aa  45.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  51.22 
 
 		 488 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  33.66 
 
 		 461 aa  45.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  57.14 
 
 		 466 aa  44.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  57.14 
 
 		 466 aa  44.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  52.63 
 
 		 1073 aa  44.3  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 208 aa  44.3  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>