19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0082 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0082  hypothetical protein  100 
 
 		 769 aa  1595    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00502388  hitchhiker  0.00904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3444  hypothetical protein  38.06 
 
 		 1040 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1582  hypothetical protein  37.85 
 
 		 1051 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2699  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1041 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000707036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2869  hypothetical protein  37.34 
 
 		 1041 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1571  hypothetical protein  36.98 
 
 		 1041 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2767  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1041 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2969  hypothetical protein  36.52 
 
 		 1040 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0428222 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1390  hypothetical protein  36.39 
 
 		 1040 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1374  hypothetical protein  37.17 
 
 		 1040 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1413  hypothetical protein  37.17 
 
 		 1040 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  29.63 
 
 		 589 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  33.04 
 
 		 647 aa  48.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  33.64 
 
 		 453 aa  47  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  32.14 
 
 		 486 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  30.95 
 
 		 488 aa  44.7  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  32.14 
 
 		 486 aa  44.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  32.73 
 
 		 453 aa  44.3  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 609 aa  44.3  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>