More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0969 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 375 aa  766    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  69.33 
 
 		 375 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  67.91 
 
 		 381 aa  531  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  68.72 
 
 		 375 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  63.34 
 
 		 385 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  60.38 
 
 		 386 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  59.73 
 
 		 389 aa  431  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  53.07 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  52.56 
 
 		 373 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  52.56 
 
 		 378 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  51.48 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  51.48 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  51.6 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  51.47 
 
 		 375 aa  359  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  51.2 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  51.47 
 
 		 384 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  50.93 
 
 		 385 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  45.99 
 
 		 381 aa  299  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  43.3 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  43.79 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  41.51 
 
 		 368 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  41.6 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  41.95 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  37.22 
 
 		 400 aa  202  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 388 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  25.34 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 806 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  27.35 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  27.35 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 806 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 815 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  23.56 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  21.08 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 		 823 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 806 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5914  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  22.35 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 805 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.51 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  23.24 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 799 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 816 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 815 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 812 aa  66.6  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 816 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.43 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  22.96 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  29.82 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1351  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1596  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 821 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26338 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  21.93 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.97 
 
 		 838 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  23.77 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 816 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 817 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0452  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000226129  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  24.48 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>