More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0490 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 361 aa  722    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  56.98 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  56.15 
 
 		 368 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  56.15 
 
 		 368 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  52.79 
 
 		 357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 		 378 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  43.99 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 378 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  42.43 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  41.89 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  43.13 
 
 		 375 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 375 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  42.21 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  43.06 
 
 		 375 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  41.87 
 
 		 379 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  43.63 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  40.54 
 
 		 375 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  42.09 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  43.15 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  40.12 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  41.28 
 
 		 400 aa  219  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  37.64 
 
 		 383 aa  215  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  29.1 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  28.73 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  30.14 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3891  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  23.84 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  28.79 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4795  putative D-amino-acid dehydrogenase  30.04 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.81 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  32.6 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  22.16 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  27.46 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  30.81 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  30.81 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  31.89 
 
 		 418 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  25.23 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  29.68 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  25.23 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  28 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  52.63 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 817 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  29.87 
 
 		 413 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  50.88 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  28.42 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  50.88 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  50.88 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  50.88 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  25.48 
 
 		 476 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  49.12 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>