210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3007 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 400 aa  775    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  46.6 
 
 		 383 aa  272  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  43.92 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  41.44 
 
 		 378 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  41.05 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  41.8 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 378 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  41.87 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  40.91 
 
 		 375 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  39.26 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  40.83 
 
 		 389 aa  246  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 		 367 aa  242  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  41.85 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  39.62 
 
 		 375 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  41.24 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  42.29 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  41.44 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  41.62 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  40.33 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 374 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  41.64 
 
 		 369 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 357 aa  211  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  43.95 
 
 		 376 aa  193  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  27.68 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 815 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 816 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  21.74 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3929  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 835 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  23.11 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 817 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.17 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  27.17 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  26.29 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 819 aa  57  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 		 815 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  26.25 
 
 		 831 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  27.05 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 831 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.42 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 492 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  25 
 
 		 831 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 		 806 aa  52.8  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  26.98 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.06 
 
 		 838 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 815 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 494 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 812 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 		 382 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>