More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3225 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3225  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  719    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3246  FAD dependent oxidoreductase  88.56 
 
 
368 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548374  normal  0.597493 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3563  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase protein  88.01 
 
 
368 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0926  FAD dependent oxidoreductase  59.78 
 
 
357 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0490  FAD dependent oxidoreductase  56.98 
 
 
361 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0127123  normal  0.162763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5086  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00135818  normal  0.404785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1558  FAD dependent oxidoreductase  43.14 
 
 
386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3567  FAD dependent oxidoreductase  42.32 
 
 
381 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1468  FAD dependent oxidoreductase  43.88 
 
 
375 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1877  FAD dependent oxidoreductase  44.09 
 
 
378 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2246  FAD dependent oxidoreductase  42.36 
 
 
378 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.721245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3492  FAD dependent oxidoreductase  43.01 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2247  FAD dependent oxidoreductase  42.07 
 
 
375 aa  229  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2431  FAD dependent oxidoreductase  41.29 
 
 
379 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1627  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 
375 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0969  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
375 aa  222  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1242  hypothetical protein  41.85 
 
 
375 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14010  putative amino acid oxidase  41.01 
 
 
375 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0341908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3007  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 
400 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.469036  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2008  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1429  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 
383 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4871  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 
367 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4053  FAD dependent oxidoreductase  41.9 
 
 
389 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0820  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 
384 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1312  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 
375 aa  202  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.544438  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1083  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
369 aa  202  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0166  FAD dependent oxidoreductase  42.29 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4669  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 
374 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1355  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 
369 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000118707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2315  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 
390 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1837  FAD dependent oxidoreductase  35.37 
 
 
381 aa  185  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1132  FAD dependent oxidoreductase  39.58 
 
 
376 aa  179  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.710335  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0434  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
382 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 
392 aa  86.3  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
500 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  27.63 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  27.19 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
485 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.49 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04101  putative sarcosine oxidase  25.51 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0903484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
823 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
492 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3393  sarcosine oxidase, beta subunit family  25 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0208125  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02147  hypothetical protein  26.43 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  31.82 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  26.26 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  27.82 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
806 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  22.38 
 
 
479 aa  63.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 
383 aa  63.5  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  26.58 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2070  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 
479 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  27.27 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  32.05 
 
 
403 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 
500 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 
395 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 
816 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
401 aa  60.1  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
390 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.09 
 
 
389 aa  60.1  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 
394 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 
376 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 
385 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 
395 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>