More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1848 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1848  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 378 aa  766    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.26 
 
 		 386 aa  155  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 390 aa  136  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 382 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 385 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 500 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 496 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 385 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 492 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 801 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  29.17 
 
 		 394 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 394 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1952  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00345362  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  28.33 
 
 		 822 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 806 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 815 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 385 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 819 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 816 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 805 aa  90.5  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 399 aa  89.7  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 816 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 		 816 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 815 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 815 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0926  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 		 817 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 827 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  24.27 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 		 815 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 806 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 823 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  25.97 
 
 		 879 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0939  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 797 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 843 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 804 aa  80.9  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5112  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 		 806 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0323529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3496  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  23.69 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.84 
 
 		 857 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.06 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 799 aa  76.6  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1985  FAD dependent oxidoreductase  22.35 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.886969  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 983 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3229  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267382  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 812 aa  74.3  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4757  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.31 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  24.17 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.64 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.64 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 984 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.64 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  24.64 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  24.64 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  24.64 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  23.01 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  23.89 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  30.37 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 825 aa  69.7  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>