109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5749 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5749  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 356 aa  739    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  49.14 
 
 		 354 aa  352  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1765  hypothetical protein  39.48 
 
 		 372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3234  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  33.99 
 
 		 357 aa  232  9e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1858  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 357 aa  212  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1216  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550481 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0920  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0105145  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1501  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 362 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655883 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00745  hypothetical protein  30.48 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0783  putative FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0786  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.766531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4213  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 370 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.1387  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1669  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  23.4 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  23.03 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  23.4 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  23.03 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  23.4 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  21.25 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  22.6 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  23.12 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2155  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)-like protein  23.3 
 
 		 604 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.195632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  22.31 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  22.75 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 371 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.43 
 
 		 644 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  27.48 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3369  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.93 
 
 		 673 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00235092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  24.02 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2100  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.258817  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  29.66 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  23.16 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  24.39 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.33 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.16 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  22.67 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  22.19 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  22.82 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.66 
 
 		 676 aa  50.1  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01191  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  27.13 
 
 		 741 aa  49.7  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.97 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.4 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.16 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.08 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  21.69 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.08 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.65 
 
 		 675 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1458  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.4 
 
 		 675 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.08 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  22.16 
 
 		 690 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1410  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.04 
 
 		 689 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000203784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  20.6 
 
 		 668 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0372  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.1 
 
 		 689 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000353518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.1 
 
 		 689 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  23.01 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03106  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.55 
 
 		 672 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  21.87 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  21.87 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  27.59 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  28.42 
 
 		 361 aa  46.6  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0855  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 		 385 aa  46.2  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.817782  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3808  hypothetical protein  20.96 
 
 		 682 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424966  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2067  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  25.68 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  21.67 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  27.03 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2101  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.95 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3358  oxidoreductase  27.94 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  26.67 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  24.86 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0146  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00168666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2335  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0387808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  29.66 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  26.67 
 
 		 1033 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  27.42 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.32 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  20.13 
 
 		 668 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  20.13 
 
 		 668 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.85 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  24.7 
 
 		 652 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  26.95 
 
 		 631 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002869  5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme MnmC  26.06 
 
 		 672 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  20.13 
 
 		 668 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  31.3 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  25.9 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  26.06 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  20.13 
 
 		 668 aa  43.5  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>