163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2100 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2100  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 348 aa  687    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.258817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1858  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1501  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655883 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00745  hypothetical protein  20.61 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0783  putative FAD dependent oxidoreductase  19.94 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0920  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0105145  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0654  DadA family oxidoreductase  25 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.929343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  27.7 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39247  predicted protein  25.72 
 
 		 430 aa  72.8  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  26.39 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3808  hypothetical protein  22.76 
 
 		 682 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1216  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550481 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  23.35 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1765  hypothetical protein  24.51 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1494  hypothetical protein  23.06 
 
 		 666 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1489  hypothetical protein  22.8 
 
 		 666 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3234  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  22.66 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2155  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)-like protein  24.8 
 
 		 604 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.195632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0786  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.766531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.11 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1669  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1457  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.360383  normal  0.0488675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.91 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  29.27 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  25.81 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2343  hypothetical protein  30.43 
 
 		 637 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.955559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  28.66 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2377  hypothetical protein  29.2 
 
 		 667 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2424  hypothetical protein  27.7 
 
 		 637 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.28 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  27.11 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5749  FAD dependent oxidoreductase  22.9 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  27.11 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1076  protein of unknown function DUF752  28.65 
 
 		 619 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.506712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.11 
 
 		 668 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  27.11 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19400  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.85 
 
 		 654 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.11 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.11 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.77 
 
 		 668 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1605  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 641 aa  59.7  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00154209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.25 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.25 
 
 		 668 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0743  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  24.87 
 
 		 668 aa  59.3  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1390  hypothetical protein  23.97 
 
 		 622 aa  59.3  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1671  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.52 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2517  hypothetical protein  28.4 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 365 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.25 
 
 		 668 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  27.37 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1358  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.98 
 
 		 672 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0608182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.1 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.37 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.82 
 
 		 659 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.09 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0130  hypothetical protein  26.1 
 
 		 674 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000346728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.92 
 
 		 675 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  21.55 
 
 		 690 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29447  predicted protein  26.92 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.4675  normal  0.145463 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  25.07 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  24.09 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  24.09 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  24.09 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1920  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.145777 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.09 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3932  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.19 
 
 		 656 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 365 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.62 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.55 
 
 		 369 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.55 
 
 		 369 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  22.62 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.89 
 
 		 374 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1343  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.4 
 
 		 654 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  22.38 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  21.92 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  21.92 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  25.73 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2872  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.89 
 
 		 666 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  0.0703666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  23.58 
 
 		 660 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.19 
 
 		 665 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0210  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  24.36 
 
 		 631 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3369  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.27 
 
 		 673 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00235092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  23.14 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2101  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 609 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.305312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.1 
 
 		 708 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  32.89 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  24.79 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3396  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.1 
 
 		 708 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  21.64 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>