17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1457 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1457  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 324 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.360383  normal  0.0488675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1853  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.123862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2517  hypothetical protein  28.18 
 
 		 585 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1390  hypothetical protein  29 
 
 		 622 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2411  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 686 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2100  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.258817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  21.01 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2424  hypothetical protein  27.32 
 
 		 637 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  26.55 
 
 		 631 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  26.63 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1358  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.17 
 
 		 672 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0608182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2112  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0850914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4505  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.04 
 
 		 656 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7399  oxidoreductase  28.84 
 
 		 376 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1861  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  31.82 
 
 		 661 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 375 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03106  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.24 
 
 		 672 aa  42.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>