119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0654 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0654  DadA family oxidoreductase  100 
 
 		 351 aa  719    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.929343  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39247  predicted protein  27.68 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2100  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.258817  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29447  predicted protein  26.92 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.4675  normal  0.145463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  24.19 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2517  hypothetical protein  24.56 
 
 		 585 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  25.5 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  23.2 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  24.68 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  24.33 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 		 482 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0743  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  22.95 
 
 		 668 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 365 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  23.83 
 
 		 684 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4644  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  27.27 
 
 		 645 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683342  hitchhiker  0.0000257745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3577  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 		 329 aa  53.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  24.14 
 
 		 482 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  24.1 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  24.53 
 
 		 375 aa  53.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 365 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  23.32 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 491 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  23 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  22.29 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  23.89 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.81 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  23.33 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  22.84 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  21.81 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  23.62 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  20.48 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  29.79 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  22.64 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3520  D-amino-acid dehydrogenase  35.53 
 
 		 444 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.553559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.42 
 
 		 355 aa  49.7  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  22.13 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  22.64 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  22.22 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1221  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 623 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.58 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1076  protein of unknown function DUF752  27.57 
 
 		 619 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.506712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.08 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.45 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1694  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.52 
 
 		 674 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00252388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.75 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  23.42 
 
 		 1033 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  21.2 
 
 		 652 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  21.45 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.08 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  20.73 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  22.49 
 
 		 465 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  23.27 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  20.2 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  21.61 
 
 		 389 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  18.92 
 
 		 390 aa  46.6  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  20.54 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  27.56 
 
 		 364 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 494 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2914  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.32 
 
 		 660 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  20.44 
 
 		 383 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  20.44 
 
 		 383 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3396  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.32 
 
 		 708 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.71 
 
 		 367 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.32 
 
 		 708 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  21.64 
 
 		 354 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0217  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.25 
 
 		 660 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1628  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.32 
 
 		 711 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.32 
 
 		 711 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2973  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.32 
 
 		 711 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4213  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.1387  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  22.92 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  22.08 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  22.63 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  23.22 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  28.91 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  26.67 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1662  FAD dependent oxidoreductase  23.04 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.739475  normal  0.281341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  23.12 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  23.12 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  23.12 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.32 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  21.54 
 
 		 427 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1501  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3048  hypothetical protein  23.08 
 
 		 635 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.0258128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  22.9 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>