203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3577 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3577  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 329 aa  617  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  37.05 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  34.05 
 
 		 382 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  33.06 
 
 		 404 aa  102  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  33.42 
 
 		 385 aa  99.4  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  34.38 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  34.37 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  34.42 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  31.48 
 
 		 652 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  31.44 
 
 		 360 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  30 
 
 		 374 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.69 
 
 		 368 aa  85.9  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  34.65 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  30.55 
 
 		 652 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  35.65 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  29.48 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  30.3 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  24.65 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1920  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.145777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  34.44 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  31.75 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.24 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  32.75 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  32.6 
 
 		 405 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  34.65 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  32.35 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  31.47 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  32.17 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  31.87 
 
 		 666 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.66 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  31.84 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  28.35 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.07 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  32.65 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  32.65 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  32.65 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  31.58 
 
 		 666 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.91 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  31.93 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  31.35 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  32.76 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  28.45 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  31.61 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  31.67 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.58 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  29.75 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.73 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  30.35 
 
 		 1033 aa  66.6  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  27.25 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  31.67 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.91 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.91 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  25.93 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.85 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0743  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  27.89 
 
 		 668 aa  63.5  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.12 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.64 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.64 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.58 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.64 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  31.17 
 
 		 411 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  31.67 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.07 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.25 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.18 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.91 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.36 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  30.6 
 
 		 684 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0654  DadA family oxidoreductase  25 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.929343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  32.09 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4229  D-amino-acid dehydrogenase  36.13 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.825619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  24.39 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  24.39 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  29.73 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  33.08 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  29.69 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.89 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  30.65 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1076  protein of unknown function DUF752  31.75 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.506712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2102  D-amino-acid dehydrogenase  29.91 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.19 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  28.37 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  32.59 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>