32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4213 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4213  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 370 aa  751    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.1387  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1765  hypothetical protein  29.27 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00745  hypothetical protein  27.69 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1216  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 351 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1858  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 357 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20537  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5749  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0920  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0105145  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0786  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.766531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0783  putative FAD dependent oxidoreductase  21.51 
 
 		 355 aa  92  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1501  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3234  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  25.53 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1669  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  25.06 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  23.73 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.43 
 
 		 644 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3384  hypothetical protein  29.03 
 
 		 705 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  21.18 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  25.5 
 
 		 690 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1694  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.47 
 
 		 674 aa  47.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00252388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.02 
 
 		 675 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  22.64 
 
 		 375 aa  46.2  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1070  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.29 
 
 		 680 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.388206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002869  5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme MnmC  24.14 
 
 		 672 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01191  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  29.03 
 
 		 741 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  22.57 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1927  hypothetical protein  26.87 
 
 		 617 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  23.35 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>