93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3234 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3234  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  100 
 
 		 357 aa  736    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 354 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1765  hypothetical protein  41.62 
 
 		 372 aa  243  3e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5749  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00745  hypothetical protein  34.58 
 
 		 347 aa  202  6e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1858  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1216  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550481 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0920  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 350 aa  186  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0105145  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0783  putative FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1501  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 362 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1669  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0786  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.766531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4213  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.1387  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1489  hypothetical protein  22.53 
 
 		 666 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.8 
 
 		 371 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  22.53 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1494  hypothetical protein  21.46 
 
 		 666 aa  56.6  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  23.18 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  22.53 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  24.33 
 
 		 316 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.88 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  22.53 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  21.41 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  22.25 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  22.25 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  22.25 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  24.2 
 
 		 338 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  20.81 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  26.35 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  22.25 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  22.03 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3051  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 		 366 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0899897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  22.91 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  23.05 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  25.95 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2100  FAD dependent oxidoreductase  21.6 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.258817  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  23.3 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  24.82 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2540  FAD dependent oxidoreductase  23.3 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0170113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  31.25 
 
 		 1033 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  29.46 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2890  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 392 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0610119 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.4 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.4 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0880  oxidoreductase  23.3 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0146  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00168666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  21.33 
 
 		 367 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1605  FAD dependent oxidoreductase  21.26 
 
 		 641 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00154209  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0153  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0141  FAD dependent oxidoreductase  22.09 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  27.94 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  21.43 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  21.29 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2335  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0387808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  23.94 
 
 		 372 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  21.08 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  24.46 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  21.51 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.63 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.35 
 
 		 675 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  26.95 
 
 		 342 aa  46.6  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  23.4 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  23.4 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  23.4 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  22.93 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3154  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.358247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3277  FAD dependent oxidoreductase  21.27 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1671  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.93 
 
 		 654 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  22.53 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  18.8 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  28.65 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3293  FAD dependent oxidoreductase  39.39 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  21.88 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1989  hypothetical protein  25.23 
 
 		 739 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19400  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.56 
 
 		 654 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.91 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  24.65 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  27.21 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.59 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.56 
 
 		 367 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  26.11 
 
 		 367 aa  42.7  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>