135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00745 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00745  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  706    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1858  FAD dependent oxidoreductase  43.15 
 
 		 357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20537  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0920  FAD dependent oxidoreductase  39 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0105145  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1765  hypothetical protein  34.4 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3234  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  34.58 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1216  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5749  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1501  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655883 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0783  putative FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4213  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.1387  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1669  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0786  FAD dependent oxidoreductase  22.71 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.766531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  21.39 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2100  FAD dependent oxidoreductase  19.25 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.258817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  22.16 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  22.8 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  22.44 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  23.03 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  22.78 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  22.4 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  22.4 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  22.4 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  22.03 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  21.26 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.1 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  23.33 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.14 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.4 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  22.4 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  22.06 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  22.07 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  21.19 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  22.04 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  22.32 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  21.8 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  20.33 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.07 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0855  FAD dependent oxidoreductase  20.76 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.817782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  28.28 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  22.34 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  19.61 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  23.58 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  21.53 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  19.61 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  20.51 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  22.1 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  22.1 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  25.93 
 
 		 690 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  20.86 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1284  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.96 
 
 		 613 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000566158  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1494  hypothetical protein  23.21 
 
 		 666 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.41 
 
 		 375 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  20.73 
 
 		 368 aa  52.8  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1489  hypothetical protein  23.21 
 
 		 666 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2335  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0387808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  21.37 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  22.93 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  21.33 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.12 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  21.33 
 
 		 339 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  20.11 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  20.11 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  20.11 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  19.26 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  23.68 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  20.45 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  21.69 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0457  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.12 
 
 		 613 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000000895922  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  21.66 
 
 		 334 aa  49.3  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  27.33 
 
 		 367 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  22.07 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1641  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.7 
 
 		 616 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.168869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  22.35 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  21.66 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  18.84 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  28.97 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  19.88 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.74 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  27.87 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  24.49 
 
 		 631 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  23.72 
 
 		 356 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  19.71 
 
 		 373 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0496  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.03 
 
 		 621 aa  47.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  25.32 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  22.02 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23.3 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  24.83 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  21.49 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  24.69 
 
 		 346 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  20.62 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>