40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1216 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1216  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 351 aa  720    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 354 aa  232  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1765  hypothetical protein  36.6 
 
 		 372 aa  229  4e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1858  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00745  hypothetical protein  30.64 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3234  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  29.77 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5749  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0783  putative FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1501  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655883 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0920  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0105145  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1669  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4213  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 370 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.1387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0786  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 346 aa  98.6  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.766531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  21.95 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  21.95 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1920  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.145777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  22.1 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  21.74 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  21.74 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2100  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.258817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  20.92 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  21.47 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  21.47 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  21.47 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  21.47 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.04 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  22.07 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1828  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 		 371 aa  52.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  24.93 
 
 		 361 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  22.87 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  24.51 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.59 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  24.59 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1098  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 482 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.487922  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  23.33 
 
 		 391 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  20.6 
 
 		 367 aa  42.7  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 		 437 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>