More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1236 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1236  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  100 
 
 		 415 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1933  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  100 
 
 		 415 aa  820    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0305  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  100 
 
 		 415 aa  820    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1670  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  820    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0223  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  92.29 
 
 		 445 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0215  putative D-amino acid dehydrogenase 2, small subunit  99.76 
 
 		 415 aa  817    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2211  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  100 
 
 		 415 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0948  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  99.76 
 
 		 415 aa  817    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4708  D-amino-acid dehydrogenase  69.86 
 
 		 416 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0268741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4441  D-amino acid dehydrogenase 2 small subunit  62.03 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136724  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3716  D-amino-acid dehydrogenase  52.12 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4229  D-amino-acid dehydrogenase  50.37 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.825619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0700  D-amino acid dehydrogenase small subunit  48.35 
 
 		 425 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2001  D-amino-acid dehydrogenase  49.88 
 
 		 416 aa  362  6e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67150  putative oxidoreductase  51.57 
 
 		 416 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5823  putative oxidoreductase  49.64 
 
 		 416 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5290  D-amino-acid dehydrogenase  46.62 
 
 		 413 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2589  D-amino acid dehydrogenase small subunit  48.03 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2074  D-amino acid dehydrogenase small subunit  47.14 
 
 		 422 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1999  D-amino-acid dehydrogenase  47.28 
 
 		 403 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2467  D-amino acid dehydrogenase small subunit  47.38 
 
 		 422 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0313  D-amino acid dehydrogenase small subunit  39.4 
 
 		 421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2864  D-amino-acid dehydrogenase  41.5 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.30815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004326  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.23 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  43.44 
 
 		 419 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1385  D-amino-acid dehydrogenase  41.9 
 
 		 401 aa  298  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  41.59 
 
 		 417 aa  298  8e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6079  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.46 
 
 		 421 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2304  D-amino-acid dehydrogenase  42.45 
 
 		 421 aa  296  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.018021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0804  D-amino acid dehydrogenase small subunit  40.79 
 
 		 433 aa  296  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  39.09 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1556  D-amino-acid dehydrogenase  45.76 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2262  D-amino acid dehydrogenase small subunit  46.57 
 
 		 425 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.66021  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4311  D-amino-acid dehydrogenase  45.5 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  39.42 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  41.49 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  42.68 
 
 		 418 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.61 
 
 		 416 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3877  D-amino-acid dehydrogenase  45.64 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4777  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.46 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565064  normal  0.111911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0808  D-amino acid dehydrogenase small subunit  39.23 
 
 		 416 aa  285  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01164  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.44 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2459  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  38.44 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2436  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.44 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0019507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1292  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.44 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000190637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01174  hypothetical protein  38.44 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1334  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.44 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195044  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1960  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.44 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00842903  normal  0.752905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1347  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.44 
 
 		 432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.15982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1676  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.44 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000458622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0528  D-amino-acid dehydrogenase  40.86 
 
 		 443 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0091768  hitchhiker  0.00000110387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  38.46 
 
 		 433 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0444  D-amino-acid dehydrogenase  37.74 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.22 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1408  D-amino-acid dehydrogenase  43.31 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1936  D-amino-acid dehydrogenase  45.65 
 
 		 429 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1545  D-amino-acid dehydrogenase  44.39 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3113  D-amino acid dehydrogenase small subunit  41.59 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1813  FAD dependent oxidoreductase  39.9 
 
 		 417 aa  280  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.98 
 
 		 434 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.98 
 
 		 434 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.98 
 
 		 434 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.98 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  41.35 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3638  D-amino-acid dehydrogenase  47 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.76 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1301  D-amino acid dehydrogenase small subunit  39.46 
 
 		 418 aa  276  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1094  FAD dependent oxidoreductase  40.86 
 
 		 421 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0886  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 439 aa  276  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03073  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.94 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4473  D-amino-acid dehydrogenase  40.39 
 
 		 417 aa  275  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.26 
 
 		 434 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.74 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4178  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.52 
 
 		 428 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.57 
 
 		 428 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0948  D-amino-acid dehydrogenase  38.73 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1023  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.52 
 
 		 428 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0751  D-amino-acid dehydrogenase  40.19 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1064  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.52 
 
 		 428 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0585  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.52 
 
 		 428 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1957  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.34 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1444  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.77 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4434  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.69 
 
 		 432 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00000811455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4738  D-amino-acid dehydrogenase  44.12 
 
 		 408 aa  270  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2253  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.34 
 
 		 417 aa  269  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0558  D-amino-acid dehydrogenase small subunit  34.56 
 
 		 419 aa  269  8.999999999999999e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  38.94 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2363  D-amino acid dehydrogenase small subunit  37.56 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1941  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.98 
 
 		 432 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1515  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.98 
 
 		 432 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.684243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.98 
 
 		 432 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3159  D-amino-acid dehydrogenase  39.76 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.5 
 
 		 434 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5009  D-amino-acid dehydrogenase  38.08 
 
 		 448 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2122  D-amino-acid dehydrogenase  39.01 
 
 		 421 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17481  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0866  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.23 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0069  D-amino-acid dehydrogenase  43.56 
 
 		 411 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1945  D-amino acid dehydrogenase small subunit  36.98 
 
 		 432 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3394  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 414 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.361362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>