203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2023 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2023  putative iron-sulphur protein  100 
 
 
138 aa  275  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.304006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  58.14 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.36 
 
 
207 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.59 
 
 
204 aa  100  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  46.28 
 
 
124 aa  93.2  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.28 
 
 
124 aa  93.2  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.28 
 
 
124 aa  93.2  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  47.92 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  49.44 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.16 
 
 
146 aa  84  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.23 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.83 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.93 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.84 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.01 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.07 
 
 
122 aa  77  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.4 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.16 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.41 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3110  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.48 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912121  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0519  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.94 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.57 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211391  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.16 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.57 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05090  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  41.13 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.884947  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  43.33 
 
 
160 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  33.96 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  33.61 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.17 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.29 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  36.96 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  37.63 
 
 
181 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.37 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  37.63 
 
 
181 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  35.48 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.18 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.71 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  37.78 
 
 
181 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  35.05 
 
 
181 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  36.9 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4538  Rieske (2Fe-2S) region  25.19 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.29 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.89 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.5 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1751  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.9 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  34.33 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  45.9 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.52 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2207  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  40.28 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.58 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5208  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.82 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 
531 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2703  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  33.33 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  37.78 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5894  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
506 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
513 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.01 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 
508 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 
381 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.71 
 
 
644 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.25 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.8 
 
 
642 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  42.86 
 
 
645 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  41.54 
 
 
139 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  40.32 
 
 
647 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.44 
 
 
139 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0241  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.57 
 
 
168 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.923005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  45.16 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.96 
 
 
227 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  32.58 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 
526 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3259  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.75 
 
 
269 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  35 
 
 
504 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  37.8 
 
 
207 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3146  Rieske Fe-S protein  43.75 
 
 
269 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.237572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1693  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44.64 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132079 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2405  Rieske Fe-S protein  31.25 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257477  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1553  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.25 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.33 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 
592 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1458  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.25 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.562172  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.62 
 
 
435 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3337  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.19 
 
 
269 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.79 
 
 
300 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.92 
 
 
639 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
504 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2131  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000114476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 
521 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.36 
 
 
206 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
513 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  40.35 
 
 
525 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  40.35 
 
 
525 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 
512 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.1 
 
 
640 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
507 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0423  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.81 
 
 
239 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4885  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.78 
 
 
172 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>