215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4885 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4885  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 
172 aa  352  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4136  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.08 
 
 
167 aa  157  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1751  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.37 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2703  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  36.67 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1876  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.04 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0535614  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  44.62 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0192  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.49 
 
 
193 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.73 
 
 
139 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  34.88 
 
 
181 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.54 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  44.44 
 
 
63 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.8 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.58 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4538  Rieske (2Fe-2S) region  25.47 
 
 
136 aa  58.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3146  Rieske Fe-S protein  33.88 
 
 
269 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.237572  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  31.96 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  38.27 
 
 
124 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.27 
 
 
124 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.27 
 
 
124 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  35.38 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3298  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.99 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.458049 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.29 
 
 
435 aa  57.4  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.54 
 
 
269 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.36 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  33.78 
 
 
181 aa  54.7  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  33.78 
 
 
181 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.27 
 
 
138 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0519  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
163 aa  54.3  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 
513 aa  54.3  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13358  predicted protein  29.82 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.01 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  40.35 
 
 
525 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  40.35 
 
 
525 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  31.08 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.85 
 
 
139 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.69 
 
 
227 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
148 aa  52  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  34.33 
 
 
181 aa  52  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5928  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.33 
 
 
220 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
507 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2207  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  43.24 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1419  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  37.65 
 
 
179 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000338056  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.74 
 
 
159 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3337  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.54 
 
 
269 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.21 
 
 
130 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.21 
 
 
130 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  34.33 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.57 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  36.84 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3259  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.54 
 
 
269 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.1 
 
 
239 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1799  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.24 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.183814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.54 
 
 
356 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
381 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.91 
 
 
130 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.7 
 
 
175 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  41.38 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.39 
 
 
639 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0423  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
239 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  37.93 
 
 
531 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
640 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 
503 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 
512 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46657  predicted protein  41.38 
 
 
217 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  40.62 
 
 
647 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  37.33 
 
 
178 aa  48.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  40.85 
 
 
149 aa  48.5  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06651  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  39.71 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 
508 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 
520 aa  48.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2023  putative iron-sulphur protein  33.78 
 
 
138 aa  47.8  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.304006  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 
499 aa  47.8  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.32 
 
 
130 aa  48.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0977  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.25 
 
 
212 aa  47.8  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  29.41 
 
 
141 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  37.33 
 
 
178 aa  47.8  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1232  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  35.29 
 
 
179 aa  47.8  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0571745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  45.31 
 
 
370 aa  47.8  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.9 
 
 
356 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 
516 aa  47.4  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 
526 aa  47.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36.84 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  43.55 
 
 
315 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2712  Rieske (2Fe-2S) region  32.84 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.79 
 
 
359 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.29 
 
 
361 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
508 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 
592 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1208  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  36.36 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  44.26 
 
 
346 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  45.1 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1794  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  40 
 
 
504 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.94 
 
 
300 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 
508 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05171  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.900646  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.62 
 
 
338 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04871  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36.49 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  42.31 
 
 
508 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  39.34 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>