More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3377 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  100 
 
 
178 aa  373  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1693  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  69.1 
 
 
177 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132079 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  47.34 
 
 
178 aa  167  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06651  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  46.75 
 
 
178 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1958  cytochrome b6/f complex Fe-S subunit  48.52 
 
 
179 aa  166  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  46.75 
 
 
178 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1799  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  48.24 
 
 
179 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.183814 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1232  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  47.34 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0571745 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04631  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  48.52 
 
 
178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0781  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  48.24 
 
 
180 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0755  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  48.24 
 
 
180 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44.97 
 
 
179 aa  158  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05181  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  45.56 
 
 
178 aa  158  4e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04871  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  45.56 
 
 
178 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44.97 
 
 
178 aa  157  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3950  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  45.88 
 
 
180 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1419  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  46.75 
 
 
179 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000338056  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1794  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44.97 
 
 
178 aa  154  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05171  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44.97 
 
 
178 aa  154  9e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.900646  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46657  predicted protein  43.64 
 
 
217 aa  144  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05261  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44.97 
 
 
178 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.100981  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13358  predicted protein  45.78 
 
 
178 aa  140  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40083  Rieske iron-sulfur protein of cytochrome b6f  39.77 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  31.58 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1432  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  29.21 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  29.21 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  29.21 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000922342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1649  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.65 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.670626  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  26.71 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1447  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.65 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 
504 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.45 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  26.49 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 
531 aa  64.7  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1246  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.53 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  47.37 
 
 
507 aa  64.3  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  57.78 
 
 
508 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  30.87 
 
 
139 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.79 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  45.31 
 
 
508 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5928  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.09 
 
 
220 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  56.82 
 
 
508 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  56.82 
 
 
508 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  56.82 
 
 
508 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  56.82 
 
 
508 aa  62  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  56.82 
 
 
508 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4538  Rieske (2Fe-2S) region  27.45 
 
 
136 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  56.82 
 
 
508 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  56.82 
 
 
508 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  56.82 
 
 
508 aa  62  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  56.82 
 
 
508 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  56.82 
 
 
508 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.6 
 
 
227 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2703  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  36.51 
 
 
146 aa  61.6  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  45.76 
 
 
526 aa  62  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  41.25 
 
 
131 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  55.81 
 
 
513 aa  61.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  36.84 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  41.82 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 
508 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  29.49 
 
 
182 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  29.14 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  29.22 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.68 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  26.88 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.11 
 
 
141 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0192  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.18 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  41.94 
 
 
525 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  48.94 
 
 
504 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  43.14 
 
 
525 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
513 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.41 
 
 
139 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3337  Rieske (2Fe-2S) domain protein  58.54 
 
 
269 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  56.1 
 
 
516 aa  58.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1464  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 
435 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3259  Rieske (2Fe-2S) domain protein  58.54 
 
 
269 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  53.49 
 
 
512 aa  58.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.26 
 
 
124 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.26 
 
 
124 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  44.26 
 
 
124 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 
521 aa  58.2  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.85 
 
 
130 aa  57.4  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  46.3 
 
 
592 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  27.83 
 
 
521 aa  57.8  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  51.22 
 
 
510 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1578  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  29.41 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.83 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3767  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30.07 
 
 
146 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1544  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30.07 
 
 
146 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 
499 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1685  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  29.41 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1616  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30.07 
 
 
146 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0880951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.52 
 
 
479 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.19 
 
 
130 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.19 
 
 
130 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 
520 aa  55.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 
513 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4400  FAD dependent oxidoreductase  51.22 
 
 
513 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3146  Rieske Fe-S protein  56.1 
 
 
269 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.237572  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0520  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.31 
 
 
187 aa  54.7  0.0000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.701986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>