270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4538 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4538  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
136 aa  278  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2703  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  65.07 
 
 
146 aa  178  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.48 
 
 
141 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05181  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  41.89 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  41.89 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04871  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  41.89 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  33.59 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.59 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.59 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0755  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.33 
 
 
180 aa  66.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0781  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.33 
 
 
180 aa  66.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04631  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  39.19 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1794  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  30.32 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.96 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05171  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  30.32 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.900646  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3146  Rieske Fe-S protein  40.54 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.237572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3337  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.43 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1958  cytochrome b6/f complex Fe-S subunit  31.37 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  31.87 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3259  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.43 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06651  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  43.55 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  37.84 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  28.97 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3950  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  40.28 
 
 
180 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.84 
 
 
159 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  38.03 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  26.85 
 
 
182 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  45.76 
 
 
513 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05261  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  44.44 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.100981  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13358  predicted protein  44.83 
 
 
178 aa  62.8  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1751  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.07 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 
513 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.76 
 
 
171 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  35.21 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  32.43 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46657  predicted protein  29.87 
 
 
217 aa  61.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1799  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  40.32 
 
 
179 aa  60.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.183814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 
531 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2448  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 
510 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  42.19 
 
 
525 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1232  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.89 
 
 
179 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0571745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 
504 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.27 
 
 
148 aa  60.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.99 
 
 
269 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.18 
 
 
178 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  25.69 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0345  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 
508 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.33 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.24 
 
 
185 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0118  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.82 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2023  putative iron-sulphur protein  27.1 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.304006  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1499  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 
499 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  40.62 
 
 
525 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1693  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  41.51 
 
 
177 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.67 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  47.17 
 
 
647 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  33.87 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  29.17 
 
 
181 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4885  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.78 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  39.71 
 
 
507 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0172  FAD dependent oxidoreductase  46.3 
 
 
513 aa  58.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  32.89 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1447  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.32 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.267387  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40083  Rieske iron-sulfur protein of cytochrome b6f  31.65 
 
 
216 aa  58.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5928  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  38.1 
 
 
220 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 
526 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0341  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 
508 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1649  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.63 
 
 
170 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.670626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.97 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0465  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein, putative  43.4 
 
 
508 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0461  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  43.4 
 
 
508 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 
592 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 
508 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3767  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  33.78 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.22 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1685  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  33.78 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1432  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.97 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.97 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1404  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.97 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000922342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0413  oxidoreductase  41.51 
 
 
508 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1578  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  33.78 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1419  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.98 
 
 
179 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000338056  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4905  oxidoreductase  41.51 
 
 
508 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0350  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  41.51 
 
 
508 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0333  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  41.51 
 
 
508 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0336  oxidoreductase, with Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  41.51 
 
 
508 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0365  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  41.51 
 
 
508 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1544  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  32.43 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 
239 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0399  putative Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  41.51 
 
 
508 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2065  oxidoreductase  38.89 
 
 
507 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1616  menaquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  32.43 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0880951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  44.26 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  39.68 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1246  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0423  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.24 
 
 
239 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  51.02 
 
 
647 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  51.02 
 
 
647 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>