281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3864 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  275  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.86 
 
 
138 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.11 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  47.11 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.11 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.3 
 
 
128 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.26 
 
 
204 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.79 
 
 
207 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  56.32 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  56.98 
 
 
192 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.89 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3110  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.83 
 
 
166 aa  88.6  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912121  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0519  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.95 
 
 
163 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.94 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.09 
 
 
161 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.24 
 
 
160 aa  84  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211391  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2023  putative iron-sulphur protein  46.53 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.304006  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05090  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  56.16 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.884947  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  43.69 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  47.19 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.05 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.25 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.25 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.45 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  41.57 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.39 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5208  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.05 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.89 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.08 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 
435 aa  64.3  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  39.58 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.46 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 
526 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.57 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.26 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.3 
 
 
171 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  36.08 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.86 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  37.97 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.38 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1235  hypothetical protein  32.56 
 
 
504 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3146  Rieske Fe-S protein  47.62 
 
 
269 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.237572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2703  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  32.19 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  34.88 
 
 
181 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  52.54 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.48 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  38.82 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  53.33 
 
 
647 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  58.18 
 
 
516 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  48.39 
 
 
206 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.67 
 
 
381 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.71 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.55 
 
 
269 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.41 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  45.45 
 
 
429 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  37.14 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  28.57 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  33.57 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.46 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4136  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.47 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.04 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 
592 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1553  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.29 
 
 
168 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  31.37 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2405  Rieske Fe-S protein  34.29 
 
 
168 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  45.31 
 
 
315 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1458  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.29 
 
 
168 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.562172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
512 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  33.98 
 
 
181 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  36.05 
 
 
182 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0241  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.14 
 
 
168 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.923005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0192  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.37 
 
 
193 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.09 
 
 
294 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  42.37 
 
 
647 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4538  Rieske (2Fe-2S) region  28.37 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1693  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.08 
 
 
177 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  42.42 
 
 
414 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.08 
 
 
374 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
513 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  46.15 
 
 
648 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.42 
 
 
414 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 
215 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.42 
 
 
414 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04871  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  40.32 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  45 
 
 
645 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  42.37 
 
 
647 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.43 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.733443  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  41.54 
 
 
392 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  40.32 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
531 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.46 
 
 
343 aa  52  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3337  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.61 
 
 
269 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  31.29 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3259  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.61 
 
 
269 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05181  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  40.32 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2207  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.04 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>