101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5208 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5208  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
136 aa  264  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.27 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.09 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.74 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  37.78 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0519  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.07 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.11 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.48 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3110  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912121  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.45 
 
 
381 aa  63.5  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211391  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.78 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.84 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  32.99 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  34.88 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.56 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  38.71 
 
 
160 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.73 
 
 
207 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
204 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.83 
 
 
192 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.08 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2207  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  43.37 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.53 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  36.54 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  37.93 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2023  putative iron-sulphur protein  36.73 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.304006  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05090  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.69 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.884947  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  31.97 
 
 
124 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.97 
 
 
124 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.97 
 
 
124 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2157  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.69 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00819561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.31 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  38.61 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.93 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  36.63 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
435 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  40.74 
 
 
521 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.75 
 
 
521 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  33.33 
 
 
170 aa  47.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.69 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.33 
 
 
364 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.19 
 
 
521 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.48 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  32.41 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.97 
 
 
286 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.63 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.17 
 
 
516 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  36.14 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.37 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.38 
 
 
644 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.02 
 
 
509 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  40.68 
 
 
647 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
531 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 
159 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_325  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  35.06 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.168173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  28.57 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  31.31 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  30.39 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  40.62 
 
 
363 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  36.92 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3081  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.59 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0978825  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0363  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.93 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  34.48 
 
 
291 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.61 
 
 
513 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.3 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  29.29 
 
 
238 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0381  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.77 
 
 
125 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000348329  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  41.67 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.61 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.12 
 
 
101 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.82 
 
 
285 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
526 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.81 
 
 
322 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.57 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 
513 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.9 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.94 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0977  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.86 
 
 
212 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2486  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.47 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.04 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.05 
 
 
105 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4570  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.05 
 
 
105 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0919723  hitchhiker  0.000210645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  33.72 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  29.27 
 
 
104 aa  40  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1970  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.73 
 
 
546 aa  40.4  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3091  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  41.3 
 
 
647 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  41.3 
 
 
647 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  34.48 
 
 
116 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>