23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_325 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_325  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  100 
 
 		 132 aa  275  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.168173  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0363  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  93.18 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878318  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0381  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  94.4 
 
 		 125 aa  247  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000348329  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0580  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.91 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0303842  normal  0.553094 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.18 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.430111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3146  Rieske Fe-S protein  40 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.237572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3259  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.21 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3337  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.21 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.02 
 
 		 269 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.54 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0549  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 		 414 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.369608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0597  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 		 414 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0052075  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0763  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.14 
 
 		 360 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2624  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 		 384 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5208  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.06 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.74 
 
 		 412 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.65 
 
 		 289 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 639 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1680  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  37.25 
 
 		 447 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0990  hypothetical protein  29.33 
 
 		 506 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3062  iron-sulfur cluster-binding protein, rieske family  35.29 
 
 		 416 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.46 
 
 		 130 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>