98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2157 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2157  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
182 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00819561  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.69 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.53 
 
 
381 aa  58.2  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.7 
 
 
161 aa  57.8  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4136  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.88 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.71 
 
 
160 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211391  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  35.42 
 
 
159 aa  55.1  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3110  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 
166 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912121  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 
149 aa  52  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5208  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.69 
 
 
136 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.25 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.57 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.21 
 
 
108 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2207  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  39.29 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 
119 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  34.34 
 
 
238 aa  48.5  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.7 
 
 
171 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  38.75 
 
 
111 aa  48.5  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
105 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 
151 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.51 
 
 
105 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  39.71 
 
 
370 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.62 
 
 
107 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.21 
 
 
114 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.52 
 
 
142 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 
159 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.09 
 
 
146 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  32.88 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.14 
 
 
112 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.93 
 
 
111 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.8 
 
 
105 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.61 
 
 
139 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.71 
 
 
136 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
349 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  30.67 
 
 
151 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.71 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.25 
 
 
105 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29 
 
 
105 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
526 aa  45.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.05 
 
 
131 aa  44.7  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.39 
 
 
104 aa  44.7  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.75 
 
 
300 aa  44.7  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  36.9 
 
 
120 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  41.79 
 
 
141 aa  44.3  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  38.46 
 
 
345 aa  44.3  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.44 
 
 
441 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.48 
 
 
435 aa  43.9  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.44 
 
 
372 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
109 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2067  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.767488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.96 
 
 
360 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.96 
 
 
352 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  32.5 
 
 
113 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  31.68 
 
 
656 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.92 
 
 
349 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  30.95 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.5 
 
 
382 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  37.5 
 
 
354 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  32.67 
 
 
120 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  40.62 
 
 
369 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  40.62 
 
 
365 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.16 
 
 
122 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.35 
 
 
120 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  36.9 
 
 
96 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  28.57 
 
 
105 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.44 
 
 
640 aa  42.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  29.41 
 
 
110 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  34.25 
 
 
105 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 
506 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
102 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.76 
 
 
370 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.85 
 
 
102 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3091  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
104 aa  42  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.94 
 
 
119 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.41 
 
 
115 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  33.85 
 
 
102 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  32.61 
 
 
141 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  40.35 
 
 
518 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.38 
 
 
338 aa  41.6  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
592 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.82 
 
 
364 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.8 
 
 
107 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
132 aa  41.2  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  29.59 
 
 
105 aa  41.2  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  33.8 
 
 
111 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
368 aa  41.2  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  26.03 
 
 
270 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
112 aa  41.2  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.98 
 
 
513 aa  41.2  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3298  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.42 
 
 
154 aa  41.2  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.458049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  27.88 
 
 
133 aa  40.8  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.92 
 
 
139 aa  40.8  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.77 
 
 
159 aa  40.8  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>