More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09350 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  100 
 
 
141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.54 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
171 aa  77  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.19 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.43 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.22 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  37.86 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  41.86 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.29 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  36.67 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  38.3 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  32.98 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  34.45 
 
 
369 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.45 
 
 
360 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.02 
 
 
349 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  49.18 
 
 
370 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  36.17 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  48.39 
 
 
349 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  48.39 
 
 
345 aa  62  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.51 
 
 
330 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.44 
 
 
227 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.87 
 
 
199 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.42 
 
 
435 aa  60.8  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.39 
 
 
355 aa  60.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.33 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.77 
 
 
374 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.71 
 
 
338 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
175 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.33 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.65 
 
 
372 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.5 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  33.92 
 
 
207 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  46.77 
 
 
365 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  43.55 
 
 
354 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  45.16 
 
 
358 aa  57  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.96 
 
 
207 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  32.09 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.61 
 
 
523 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.16 
 
 
343 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  44.78 
 
 
315 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45 
 
 
356 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  35.42 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.83 
 
 
204 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.04 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.69 
 
 
370 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 
508 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  41.18 
 
 
346 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5208  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.93 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.55 
 
 
364 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.73 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  35.42 
 
 
392 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.16 
 
 
368 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.59 
 
 
441 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  48.33 
 
 
399 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 
526 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.07 
 
 
356 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.15 
 
 
233 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.36 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 
604 aa  53.9  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.26 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.57 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.41 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0727  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
520 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  47.17 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05090  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.61 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.884947  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.45 
 
 
300 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.98 
 
 
359 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.98 
 
 
361 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.08 
 
 
294 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  35.71 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1751  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.03 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3176  rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  35.42 
 
 
525 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
414 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
414 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1353  oxidoreductase  38.82 
 
 
521 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 
516 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  34.91 
 
 
289 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
414 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2861  Rieske 2Fe-2S iron-sulfur protein  35.42 
 
 
525 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  42.42 
 
 
647 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  35.29 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  37.36 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.98 
 
 
361 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  35.71 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.44 
 
 
406 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  44.44 
 
 
292 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  37.21 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.93 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.84 
 
 
215 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  50 
 
 
647 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.23 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 
531 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.88 
 
 
382 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  36.78 
 
 
203 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.71 
 
 
381 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  48.28 
 
 
524 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  47.54 
 
 
63 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
402 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>