117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2473 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
215 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  70.05 
 
 
209 aa  276  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.68 
 
 
233 aa  262  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  40.79 
 
 
365 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.65 
 
 
361 aa  101  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.27 
 
 
361 aa  98.2  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.34 
 
 
300 aa  95.9  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.03 
 
 
349 aa  95.1  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.61 
 
 
343 aa  94  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.66 
 
 
364 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.42 
 
 
349 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  42.86 
 
 
369 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.13 
 
 
360 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  39.31 
 
 
370 aa  92.4  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  35.9 
 
 
345 aa  91.3  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.64 
 
 
370 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  33.48 
 
 
346 aa  89.4  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.08 
 
 
338 aa  89  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  37.29 
 
 
315 aa  89  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  38.13 
 
 
354 aa  88.2  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  40.37 
 
 
399 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.25 
 
 
355 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  42.06 
 
 
392 aa  85.9  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  38.46 
 
 
358 aa  85.5  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.43 
 
 
356 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.86 
 
 
382 aa  85.1  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.66 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.46 
 
 
372 aa  82  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.62 
 
 
399 aa  81.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  33.01 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  38.52 
 
 
429 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  32.62 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.87 
 
 
374 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.9 
 
 
330 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.44 
 
 
441 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  36.3 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.3 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.3 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.35 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.35 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  34.73 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.46 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  33.52 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  38.75 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.93 
 
 
151 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.58 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.55 
 
 
214 aa  58.2  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  46.43 
 
 
159 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.18 
 
 
435 aa  56.6  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  28.65 
 
 
168 aa  55.5  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.8 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.23 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.48 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.26 
 
 
136 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.88 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0943  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  28.19 
 
 
190 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.218843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37 
 
 
148 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 
141 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  37.84 
 
 
141 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 
149 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  33.64 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.84 
 
 
139 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  36.14 
 
 
139 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 
175 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.19 
 
 
639 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
134 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.44 
 
 
179 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.1 
 
 
159 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  44.64 
 
 
63 aa  48.9  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  39.66 
 
 
139 aa  48.5  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.29 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  26.17 
 
 
648 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.3 
 
 
155 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  28.83 
 
 
647 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  39.51 
 
 
148 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
186 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
381 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  39.06 
 
 
160 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.38 
 
 
135 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.1 
 
 
192 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
644 aa  45.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
239 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  34.29 
 
 
647 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  41.07 
 
 
124 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.07 
 
 
124 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.07 
 
 
124 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.27 
 
 
269 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.78 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000461965 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.18 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  43.08 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.16 
 
 
146 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.19 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1794  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  30.17 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  37.68 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  33.33 
 
 
151 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05171  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  30.17 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.900646  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.24 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>