164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1948 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  93.82 
 
 
356 aa  693    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
356 aa  733    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  62.54 
 
 
358 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  60.73 
 
 
346 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.12 
 
 
355 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  57.74 
 
 
345 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  57.93 
 
 
349 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  55.66 
 
 
338 aa  360  3e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  55.82 
 
 
343 aa  356  3.9999999999999996e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  56.84 
 
 
349 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  51.99 
 
 
354 aa  348  9e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.44 
 
 
368 aa  316  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.48 
 
 
359 aa  308  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.77 
 
 
330 aa  253  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  44.97 
 
 
369 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.13 
 
 
360 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.15 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.69 
 
 
441 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.66 
 
 
399 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  44.1 
 
 
440 aa  229  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.74 
 
 
364 aa  218  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.27 
 
 
361 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.32 
 
 
361 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  42.53 
 
 
365 aa  209  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  38.92 
 
 
370 aa  195  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  40.27 
 
 
315 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.13 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.69 
 
 
300 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.92 
 
 
370 aa  176  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  35.76 
 
 
429 aa  176  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.76 
 
 
402 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  35.76 
 
 
414 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.76 
 
 
414 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.76 
 
 
414 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  35.71 
 
 
392 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 
406 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.86 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.63 
 
 
233 aa  93.6  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.85 
 
 
199 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  39.6 
 
 
210 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  38.46 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  34.17 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  30.99 
 
 
203 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  29.47 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.51 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.79 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.63 
 
 
209 aa  63.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.18 
 
 
151 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  46.67 
 
 
159 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.78 
 
 
130 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  45 
 
 
149 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  41.18 
 
 
168 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  46.3 
 
 
205 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  45 
 
 
141 aa  56.6  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  48.15 
 
 
168 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.67 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0118  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.91 
 
 
166 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  41.54 
 
 
175 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.33 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.27 
 
 
179 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.25 
 
 
171 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  38.71 
 
 
139 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.08 
 
 
130 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.08 
 
 
130 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  41.38 
 
 
63 aa  52.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.69 
 
 
639 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0943  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.58 
 
 
190 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.218843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  39.39 
 
 
160 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  44.78 
 
 
148 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.37 
 
 
159 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  35.42 
 
 
178 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  40 
 
 
139 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  41.18 
 
 
172 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.8 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.34 
 
 
148 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.19 
 
 
178 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.66 
 
 
139 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05181  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.19 
 
 
178 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  57.89 
 
 
269 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.19 
 
 
186 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.38 
 
 
178 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.1 
 
 
146 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
122 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.29 
 
 
159 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.36 
 
 
272 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  38.98 
 
 
163 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2851  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.85 
 
 
167 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.23 
 
 
195 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0924  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
175 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06651  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  33.94 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4885  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  45.9 
 
 
172 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.82 
 
 
141 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0423  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.06 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  24.78 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  40.32 
 
 
181 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04631  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  35.78 
 
 
178 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  40.32 
 
 
181 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.38 
 
 
124 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>