95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0383 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  100 
 
 		 163 aa  339  8e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  67.27 
 
 		 165 aa  245  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  50.3 
 
 		 168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  40 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  40.91 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  47.41 
 
 		 205 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  43.85 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  39.63 
 
 		 173 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 		 199 aa  99.4  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.62 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.67 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.16 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.09 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.58 
 
 		 330 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.43 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  33.73 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  28.85 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.53 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.67 
 
 		 374 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.61 
 
 		 359 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.17 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.45 
 
 		 252 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 		 253 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  44.44 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.58 
 
 		 349 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.59 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.08 
 
 		 370 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  28.57 
 
 		 440 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  37.5 
 
 		 365 aa  50.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.98 
 
 		 372 aa  50.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.73 
 
 		 364 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  40.68 
 
 		 349 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  35.37 
 
 		 345 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.93 
 
 		 269 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  37.18 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  28.7 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 		 260 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.98 
 
 		 399 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.97 
 
 		 361 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.97 
 
 		 356 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.77 
 
 		 343 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.68 
 
 		 338 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  35.59 
 
 		 354 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3146  Rieske Fe-S protein  31.73 
 
 		 269 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.237572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.98 
 
 		 356 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.66 
 
 		 441 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  38.98 
 
 		 346 aa  48.5  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  30.12 
 
 		 392 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.23 
 
 		 360 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.88 
 
 		 368 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  35.59 
 
 		 369 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.98 
 
 		 355 aa  47.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.8 
 
 		 233 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.67 
 
 		 361 aa  47.4  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  37.93 
 
 		 315 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.74 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.59 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3259  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 		 269 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3337  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 		 269 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  37.7 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  37.29 
 
 		 358 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.76 
 
 		 370 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.66 
 
 		 300 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.71 
 
 		 435 aa  45.1  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  46.15 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.58 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  22.99 
 
 		 242 aa  43.9  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  40.38 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.37 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.82 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.87 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0423  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.26 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  23.42 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.12 
 
 		 381 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.73 
 
 		 382 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3162  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase B subunit  25.34 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.478451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.9 
 
 		 130 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.22 
 
 		 414 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.22 
 
 		 414 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  22.22 
 
 		 414 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.9 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.91 
 
 		 640 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.86 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.73 
 
 		 399 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  30.12 
 
 		 429 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.81 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04631  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.85 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.95 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.22 
 
 		 642 aa  41.2  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.33 
 
 		 402 aa  40.8  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.33 
 
 		 406 aa  40.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>