61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1370 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  42.52 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  44.09 
 
 		 173 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  44.09 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  37.5 
 
 		 163 aa  99  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  38.46 
 
 		 165 aa  98.2  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  41.24 
 
 		 168 aa  91.7  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  42.27 
 
 		 205 aa  91.3  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  40.21 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.96 
 
 		 272 aa  68.2  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.48 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.64 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.27 
 
 		 370 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.82 
 
 		 349 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 330 aa  52.8  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.64 
 
 		 359 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.57 
 
 		 364 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  38.24 
 
 		 354 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.16 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.32 
 
 		 374 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.68 
 
 		 370 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  41.38 
 
 		 392 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 		 349 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.08 
 
 		 361 aa  48.9  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 		 343 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  37.7 
 
 		 345 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  30.22 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.62 
 
 		 360 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.7 
 
 		 368 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.7 
 
 		 372 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  22.48 
 
 		 324 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 		 338 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  32.99 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  39.06 
 
 		 369 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  39.34 
 
 		 365 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  34.43 
 
 		 358 aa  45.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  36.36 
 
 		 440 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.43 
 
 		 356 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  26.5 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.09 
 
 		 399 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32.32 
 
 		 270 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.43 
 
 		 355 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.75 
 
 		 293 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.39 
 
 		 300 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.59 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 441 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.65 
 
 		 322 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  32.79 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.11 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.93 
 
 		 382 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.1 
 
 		 326 aa  43.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  25.74 
 
 		 303 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0943  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  28.17 
 
 		 190 aa  42  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.218843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  34.48 
 
 		 315 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  28.95 
 
 		 414 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.95 
 
 		 414 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.95 
 
 		 414 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>