202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2604 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
203 aa  414  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  39.13 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.2 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  41.72 
 
 
206 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  39.13 
 
 
207 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.16 
 
 
210 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  29.77 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  36.55 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.99 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.58 
 
 
356 aa  75.1  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  32.47 
 
 
365 aa  72  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.11 
 
 
343 aa  72  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.77 
 
 
338 aa  71.2  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.11 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  36.89 
 
 
345 aa  68.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.04 
 
 
349 aa  68.2  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.63 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.64 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  36.26 
 
 
358 aa  65.1  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.33 
 
 
441 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.44 
 
 
359 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.3 
 
 
370 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  39.33 
 
 
440 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  26.96 
 
 
346 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.28 
 
 
171 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  26.83 
 
 
399 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.67 
 
 
368 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.71 
 
 
349 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.07 
 
 
370 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  33.12 
 
 
392 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  41.18 
 
 
315 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  35.96 
 
 
369 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.87 
 
 
402 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  42.11 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.75 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.26 
 
 
360 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  42.53 
 
 
148 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.36 
 
 
372 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.14 
 
 
330 aa  58.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  29.22 
 
 
429 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  39.53 
 
 
141 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
406 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.43 
 
 
159 aa  58.2  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  39.47 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  53.57 
 
 
516 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.77 
 
 
130 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  38.16 
 
 
168 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.71 
 
 
141 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
361 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.19 
 
 
253 aa  55.5  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.59 
 
 
300 aa  55.1  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2207  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  44.93 
 
 
158 aa  54.7  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  26.94 
 
 
414 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.94 
 
 
414 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.94 
 
 
414 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.78 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  38.14 
 
 
168 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.55 
 
 
122 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.16 
 
 
364 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.32 
 
 
382 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.78 
 
 
138 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.11 
 
 
361 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  36.76 
 
 
181 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  39.71 
 
 
181 aa  53.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  39.74 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  37.31 
 
 
124 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.31 
 
 
124 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.31 
 
 
124 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.5 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  36.78 
 
 
141 aa  52  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.03 
 
 
146 aa  52  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.26 
 
 
435 aa  51.6  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  33.33 
 
 
173 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  39.13 
 
 
159 aa  51.2  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2734  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.94 
 
 
102 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  33.82 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36 
 
 
260 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  37.5 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  30.95 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  41.18 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  37.68 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  37.18 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  33.82 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06651  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.06 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.42 
 
 
192 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.24 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 
504 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  30.88 
 
 
182 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04631  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.04 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  41.43 
 
 
131 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  39.13 
 
 
160 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
604 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.62 
 
 
141 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.28 
 
 
155 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.62 
 
 
151 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.76 
 
 
179 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.81 
 
 
166 aa  48.5  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.11 
 
 
326 aa  48.5  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.44 
 
 
269 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>