187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14170 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  100 
 
 
354 aa  727    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.99 
 
 
356 aa  348  9e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  52.73 
 
 
345 aa  335  7e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  53.5 
 
 
349 aa  329  6e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  49.54 
 
 
346 aa  321  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  48.63 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.58 
 
 
338 aa  308  6.999999999999999e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.45 
 
 
355 aa  300  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  49.26 
 
 
358 aa  296  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.11 
 
 
343 aa  279  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.77 
 
 
359 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.61 
 
 
368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.37 
 
 
360 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.94 
 
 
372 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.51 
 
 
441 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  40 
 
 
369 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.36 
 
 
399 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  38.64 
 
 
365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  40.66 
 
 
440 aa  216  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.32 
 
 
364 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.93 
 
 
330 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.89 
 
 
300 aa  181  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  37.12 
 
 
315 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.22 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.25 
 
 
361 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.99 
 
 
361 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.44 
 
 
402 aa  175  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  34.52 
 
 
429 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  34.39 
 
 
414 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.39 
 
 
414 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.39 
 
 
414 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.98 
 
 
406 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.23 
 
 
382 aa  169  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.31 
 
 
374 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.3 
 
 
399 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.8 
 
 
370 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  35.28 
 
 
392 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.08 
 
 
233 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.11 
 
 
199 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.13 
 
 
215 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  29.77 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  40.86 
 
 
207 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  34.07 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.08 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  42.39 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.26 
 
 
214 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  29.3 
 
 
220 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.33 
 
 
210 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.74 
 
 
130 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  43.33 
 
 
149 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.69 
 
 
151 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  45.76 
 
 
159 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.52 
 
 
179 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.67 
 
 
435 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  43.55 
 
 
141 aa  57.4  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.16 
 
 
146 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.36 
 
 
186 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  40.68 
 
 
205 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  42.37 
 
 
168 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.29 
 
 
130 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  45.59 
 
 
148 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.76 
 
 
159 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.29 
 
 
130 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.93 
 
 
195 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.94 
 
 
171 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
159 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  44.93 
 
 
172 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 
175 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.17 
 
 
239 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  40.98 
 
 
139 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  37.88 
 
 
168 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  46.55 
 
 
63 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.88 
 
 
161 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0943  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.97 
 
 
190 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.218843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.45 
 
 
136 aa  52.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.12 
 
 
155 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0192  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.42 
 
 
193 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.83 
 
 
139 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  42.62 
 
 
160 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  32.94 
 
 
187 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  41.67 
 
 
139 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.43 
 
 
122 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.88 
 
 
178 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.3 
 
 
639 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.24 
 
 
199 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  34.52 
 
 
131 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.09 
 
 
272 aa  50.8  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  36.99 
 
 
173 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  42.37 
 
 
151 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  30.53 
 
 
165 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.06 
 
 
148 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.69 
 
 
139 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.32 
 
 
381 aa  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0118  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.37 
 
 
166 aa  49.7  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  45 
 
 
175 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.26 
 
 
269 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.06 
 
 
134 aa  49.7  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
504 aa  49.3  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04631  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36.05 
 
 
178 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>