66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0844 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
195 aa  403  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0943  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  65.96 
 
 
190 aa  259  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.218843 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  47.25 
 
 
187 aa  155  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  25.97 
 
 
149 aa  58.9  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  33.93 
 
 
354 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.97 
 
 
300 aa  54.7  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.88 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  32.95 
 
 
345 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.95 
 
 
349 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.85 
 
 
370 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  29.77 
 
 
175 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.44 
 
 
364 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.23 
 
 
233 aa  51.6  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.95 
 
 
338 aa  51.2  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.82 
 
 
349 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  34.09 
 
 
346 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.97 
 
 
372 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  32.95 
 
 
365 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  32.53 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  36.36 
 
 
440 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  37.5 
 
 
369 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.37 
 
 
175 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.96 
 
 
359 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.75 
 
 
360 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.23 
 
 
399 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.95 
 
 
368 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  29.82 
 
 
168 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.23 
 
 
356 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.11 
 
 
179 aa  48.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  34.48 
 
 
159 aa  48.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.92 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.48 
 
 
343 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.23 
 
 
356 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.18 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  34.62 
 
 
139 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.44 
 
 
252 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0488  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.04 
 
 
169 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  37.33 
 
 
139 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 
272 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.48 
 
 
139 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  28.7 
 
 
168 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  31.37 
 
 
207 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.91 
 
 
130 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  31.71 
 
 
203 aa  44.7  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.8 
 
 
441 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2131  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.8 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000114476  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.82 
 
 
330 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04871  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  33.68 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.92 
 
 
435 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  27.83 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  34.25 
 
 
647 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  34.25 
 
 
647 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  28.09 
 
 
358 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.55 
 
 
355 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.59 
 
 
192 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  35.29 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.99 
 
 
642 aa  42.4  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.78 
 
 
148 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
644 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.72 
 
 
238 aa  42  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
253 aa  42  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  34.85 
 
 
392 aa  41.6  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.98 
 
 
178 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 
136 aa  41.6  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05181  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.98 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>