137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3085 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
175 aa  360  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  52.91 
 
 
205 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  54.12 
 
 
168 aa  174  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  41.42 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  37.28 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  38.46 
 
 
163 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  38.69 
 
 
173 aa  121  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  40.62 
 
 
173 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.21 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41 
 
 
253 aa  75.1  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.09 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  29.24 
 
 
322 aa  70.9  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.88 
 
 
361 aa  68.9  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.11 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  34.09 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.85 
 
 
252 aa  62.4  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  30.82 
 
 
149 aa  61.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.91 
 
 
238 aa  57.8  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  39.47 
 
 
203 aa  57.8  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.54 
 
 
338 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.43 
 
 
343 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.09 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.46 
 
 
359 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.54 
 
 
372 aa  55.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.08 
 
 
349 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  27.04 
 
 
242 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.54 
 
 
356 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  42.62 
 
 
346 aa  55.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  43.28 
 
 
365 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.54 
 
 
360 aa  55.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  41.54 
 
 
399 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  41.54 
 
 
345 aa  55.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.54 
 
 
356 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.08 
 
 
355 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  41.54 
 
 
369 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  38.46 
 
 
354 aa  55.1  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  41.54 
 
 
349 aa  55.1  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  40.68 
 
 
207 aa  54.7  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  38.67 
 
 
358 aa  54.3  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.71 
 
 
272 aa  54.3  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  39.47 
 
 
370 aa  54.3  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  34.18 
 
 
440 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.13 
 
 
368 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.84 
 
 
374 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.38 
 
 
435 aa  52.4  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
195 aa  52  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  43.33 
 
 
192 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  39.66 
 
 
315 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
241 aa  50.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
330 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.47 
 
 
370 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0943  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.14 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.218843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.69 
 
 
441 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  32.14 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  37.21 
 
 
524 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
199 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.14 
 
 
300 aa  49.7  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0543  ubiquinol--cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 
508 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.86 
 
 
239 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
507 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.05 
 
 
364 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  46.34 
 
 
175 aa  48.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1320  ubiquinol--cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  29.23 
 
 
167 aa  47.4  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1201  ubiquinol--cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  29.23 
 
 
167 aa  47.4  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.54 
 
 
148 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
508 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
516 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.04 
 
 
381 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  40.74 
 
 
392 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.91 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
269 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.78 
 
 
639 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
592 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.14 
 
 
141 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2067  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.74 
 
 
145 aa  45.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.767488 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.84 
 
 
215 aa  44.7  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.46 
 
 
201 aa  44.7  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000461965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 
504 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.4 
 
 
233 aa  44.7  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0767  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.13 
 
 
479 aa  44.3  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0689797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.35 
 
 
382 aa  44.3  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  39.47 
 
 
206 aa  44.3  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
361 aa  44.3  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 
512 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36.99 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.9 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 
513 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1556  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 
604 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
361 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 
642 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0118  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.02 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.63 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.82 
 
 
399 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  31.82 
 
 
429 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.29 
 
 
640 aa  43.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  35.59 
 
 
647 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  35.59 
 
 
647 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>