91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2364 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  100 
 
 
165 aa  343  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  67.27 
 
 
163 aa  245  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  51.5 
 
 
168 aa  176  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  41.21 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  45.9 
 
 
168 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  41.73 
 
 
175 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  37.95 
 
 
205 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  44.09 
 
 
173 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
199 aa  98.2  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.19 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.07 
 
 
241 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.88 
 
 
252 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.58 
 
 
253 aa  57  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  32.14 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  28.48 
 
 
149 aa  54.3  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.55 
 
 
199 aa  54.3  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.71 
 
 
260 aa  53.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.23 
 
 
330 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
359 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  39.74 
 
 
203 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0423  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.78 
 
 
239 aa  52  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.47 
 
 
135 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
349 aa  51.6  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.29 
 
 
372 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  30.53 
 
 
354 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.86 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  26.59 
 
 
346 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
364 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  37.29 
 
 
365 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  28.7 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.91 
 
 
238 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  25.65 
 
 
242 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.11 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  40.68 
 
 
349 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
269 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.5 
 
 
399 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.91 
 
 
355 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
338 aa  48.1  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.67 
 
 
374 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.33 
 
 
361 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  32.91 
 
 
440 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35 
 
 
370 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.33 
 
 
361 aa  47.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.27 
 
 
368 aa  47.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  29.41 
 
 
315 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  25.56 
 
 
429 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  33.75 
 
 
358 aa  47.4  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.98 
 
 
356 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.66 
 
 
343 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  34.15 
 
 
345 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.63 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.98 
 
 
356 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.58 
 
 
435 aa  47  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.93 
 
 
441 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  33.9 
 
 
369 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3259  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.89 
 
 
269 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.768954  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.09 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.17 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  35.94 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  35.59 
 
 
207 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.72 
 
 
414 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.72 
 
 
414 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  24.72 
 
 
414 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3146  Rieske Fe-S protein  45.45 
 
 
269 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.237572  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.46 
 
 
300 aa  44.3  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3337  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.55 
 
 
269 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.59 
 
 
360 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.82 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  34.29 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.09 
 
 
370 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4545  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487008  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.26 
 
 
381 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  37.29 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
406 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
402 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  24.11 
 
 
322 aa  42.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28 
 
 
215 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  34.62 
 
 
392 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.79 
 
 
159 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.19 
 
 
122 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.47 
 
 
361 aa  41.6  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.53 
 
 
134 aa  41.2  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2023  putative iron-sulphur protein  34.55 
 
 
138 aa  41.2  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.304006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  43.14 
 
 
508 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.11 
 
 
326 aa  40.8  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.22 
 
 
642 aa  40.8  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  33.93 
 
 
141 aa  40.8  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.52 
 
 
148 aa  40.8  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.91 
 
 
382 aa  40.4  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>