58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0620 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  100 
 
 
322 aa  653    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  70.5 
 
 
326 aa  458  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.441209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  61.8 
 
 
324 aa  333  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.33 
 
 
361 aa  317  2e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.26 
 
 
253 aa  230  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.07 
 
 
260 aa  216  4e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  32.29 
 
 
242 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.79 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.8 
 
 
252 aa  94.7  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.75 
 
 
272 aa  95.1  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.69 
 
 
238 aa  94  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 
175 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  28.27 
 
 
210 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  30.09 
 
 
168 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  24.85 
 
 
205 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.84 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3539  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.5 
 
 
206 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.01 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.79 
 
 
360 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  31.32 
 
 
369 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0420  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28 
 
 
206 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000059328 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2666  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28 
 
 
206 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.505279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0441  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28 
 
 
206 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3676  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26 
 
 
206 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0344  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.5 
 
 
206 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  26.95 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.19 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2698  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26 
 
 
206 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2748  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26 
 
 
206 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3707  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26 
 
 
206 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3650  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26 
 
 
206 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376708  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1805  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26 
 
 
206 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3256  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26 
 
 
206 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  27.12 
 
 
354 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.27 
 
 
399 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.11 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.94 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  32.04 
 
 
365 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2977  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26 
 
 
206 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.34 
 
 
368 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  24.22 
 
 
345 aa  45.8  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  25.9 
 
 
168 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  31.11 
 
 
203 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2743  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  24 
 
 
205 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543941  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.67 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  26.29 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3544  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  24.5 
 
 
206 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.576604  normal  0.0132387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0414  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron- sulfur subunit  25 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6384  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  23.59 
 
 
206 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.29 
 
 
349 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  26.19 
 
 
187 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0368  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.5 
 
 
206 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0359  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.5 
 
 
206 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.231676  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.7 
 
 
435 aa  43.5  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  26.25 
 
 
358 aa  42.7  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  34.48 
 
 
192 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  23.42 
 
 
163 aa  42.4  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>