135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0322 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
272 aa  559  1e-158  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  61.85 
 
 
252 aa  325  5e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.11 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.19 
 
 
361 aa  94  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  31.85 
 
 
322 aa  93.6  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 
326 aa  92.8  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.63 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.48 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  30.19 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.96 
 
 
199 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  33.09 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.8 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0466  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.58 
 
 
183 aa  63.2  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  32.58 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  25.68 
 
 
168 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  27.16 
 
 
163 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  30.07 
 
 
168 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.24 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.17 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
130 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0241  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.86 
 
 
168 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.923005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1553  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.75 
 
 
168 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2405  Rieske Fe-S protein  49.25 
 
 
168 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  33.71 
 
 
175 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
435 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1458  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.27 
 
 
168 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.562172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.72 
 
 
210 aa  52.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.1 
 
 
372 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  25.54 
 
 
647 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  40.54 
 
 
365 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  30.09 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.36 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.14 
 
 
179 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0512  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25.24 
 
 
187 aa  50.1  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00341005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  24.84 
 
 
647 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  31.3 
 
 
182 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1533  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  35.85 
 
 
183 aa  50.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000181643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 
504 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  36.67 
 
 
172 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.99 
 
 
360 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  39.71 
 
 
149 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 
516 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.36 
 
 
356 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  36.99 
 
 
345 aa  48.9  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.36 
 
 
349 aa  48.9  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
338 aa  48.9  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 
356 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  30.95 
 
 
173 aa  48.9  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  31.17 
 
 
181 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.33 
 
 
138 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.79 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  28.1 
 
 
173 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2067  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.75 
 
 
145 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.767488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.57 
 
 
359 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  38.89 
 
 
369 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  40.32 
 
 
179 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  32.1 
 
 
220 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2851  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.96 
 
 
167 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  34.29 
 
 
203 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
199 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  27.7 
 
 
207 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 
195 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  37.5 
 
 
181 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13358  predicted protein  39.13 
 
 
178 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.36 
 
 
399 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  38.82 
 
 
187 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.65 
 
 
330 aa  46.6  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0781  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.46 
 
 
180 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0755  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.46 
 
 
180 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36 
 
 
381 aa  46.2  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.78 
 
 
343 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46657  predicted protein  35.29 
 
 
217 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1799  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  42.86 
 
 
179 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.183814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.33 
 
 
364 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3950  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.95 
 
 
180 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1686  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.93 
 
 
124 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36.25 
 
 
178 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0520  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  24.61 
 
 
187 aa  45.8  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.701986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  41.67 
 
 
159 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 
368 aa  45.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05181  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  36.25 
 
 
178 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1958  cytochrome b6/f complex Fe-S subunit  39.34 
 
 
179 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  39.06 
 
 
178 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1232  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  42.62 
 
 
179 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0571745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0364  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.6 
 
 
183 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.385773  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  34.25 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.79 
 
 
128 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
146 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.04 
 
 
130 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04871  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  37.68 
 
 
178 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40083  Rieske iron-sulfur protein of cytochrome b6f  38.71 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.07 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 
526 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.29 
 
 
370 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  37.68 
 
 
192 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.78 
 
 
370 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  32 
 
 
181 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
148 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.31 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 
592 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>