88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1911 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
253 aa  506  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.69 
 
 
260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  53.63 
 
 
322 aa  254  8e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.55 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.441209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  47.41 
 
 
324 aa  223  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.16 
 
 
361 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.42 
 
 
252 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.82 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.81 
 
 
238 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  35.96 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.88 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  41 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  39 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  36 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.45 
 
 
210 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.37 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.17 
 
 
360 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.56 
 
 
372 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  35.58 
 
 
165 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  28.48 
 
 
369 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.46 
 
 
233 aa  56.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
330 aa  55.8  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.48 
 
 
338 aa  55.8  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  28.49 
 
 
349 aa  55.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  39.19 
 
 
203 aa  55.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  32.03 
 
 
187 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  32.79 
 
 
163 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  30 
 
 
354 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  28.48 
 
 
365 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.6 
 
 
215 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  44.93 
 
 
192 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  26.61 
 
 
168 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  27.75 
 
 
345 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.47 
 
 
130 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  26.85 
 
 
399 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  25.68 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.38 
 
 
349 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  36.99 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  27.5 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  30.43 
 
 
173 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  39.71 
 
 
159 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.03 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.29 
 
 
368 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  26.49 
 
 
346 aa  49.7  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
435 aa  49.3  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
199 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0241  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.4 
 
 
168 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.923005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.81 
 
 
356 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  32.32 
 
 
173 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.18 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1693  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  28.26 
 
 
177 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.45 
 
 
356 aa  45.4  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.63 
 
 
370 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.49 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.49 
 
 
361 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  22.54 
 
 
359 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.55 
 
 
201 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000461965 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  28.07 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.79 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0943  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.14 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.218843 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  29.2 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.53 
 
 
171 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.01 
 
 
300 aa  43.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2405  Rieske Fe-S protein  32.28 
 
 
168 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1458  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.28 
 
 
168 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.562172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.67 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.33 
 
 
364 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1553  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.59 
 
 
168 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  25 
 
 
440 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.17 
 
 
142 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.82 
 
 
370 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0420  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.12 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000059328 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2977  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.52 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2748  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.52 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3650  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.52 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376708  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2698  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.52 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1805  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.52 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3256  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.52 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3676  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.52 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0441  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.12 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.38 
 
 
130 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3707  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.52 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2666  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.12 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.505279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
195 aa  42.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.38 
 
 
130 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  26.35 
 
 
315 aa  42  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>